Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY12

SCAPER, S phase cyclin A-associated protein in the endoplasmic reticulum, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPERQ9BY12 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
SCAPERQ9BY12 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC33.31■■■□□ 2.92
SCAPERQ9BY12 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
SCAPERQ9BY12 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
SCAPERQ9BY12 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC33.31■■■□□ 2.92
SCAPERQ9BY12 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
SCAPERQ9BY12 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC33.3■■■□□ 2.92
SCAPERQ9BY12 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
SCAPERQ9BY12 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
SCAPERQ9BY12 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
SCAPERQ9BY12 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
SCAPERQ9BY12 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
SCAPERQ9BY12 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
SCAPERQ9BY12 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
SCAPERQ9BY12 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
SCAPERQ9BY12 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
SCAPERQ9BY12 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
SCAPERQ9BY12 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
SCAPERQ9BY12 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
SCAPERQ9BY12 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
SCAPERQ9BY12 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
SCAPERQ9BY12 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
SCAPERQ9BY12 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
SCAPERQ9BY12 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
SCAPERQ9BY12 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
SCAPERQ9BY12 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
SCAPERQ9BY12 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC33.28■■■□□ 2.92
SCAPERQ9BY12 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
SCAPERQ9BY12 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
SCAPERQ9BY12 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
SCAPERQ9BY12 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
SCAPERQ9BY12 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC33.28■■■□□ 2.92
SCAPERQ9BY12 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
SCAPERQ9BY12 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
SCAPERQ9BY12 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC33.28■■■□□ 2.92
SCAPERQ9BY12 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC33.28■■■□□ 2.92
SCAPERQ9BY12 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
SCAPERQ9BY12 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
SCAPERQ9BY12 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
SCAPERQ9BY12 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
SCAPERQ9BY12 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
SCAPERQ9BY12 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
SCAPERQ9BY12 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.92
SCAPERQ9BY12 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
SCAPERQ9BY12 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
SCAPERQ9BY12 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
SCAPERQ9BY12 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.91
SCAPERQ9BY12 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
SCAPERQ9BY12 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC33.26■■■□□ 2.91
SCAPERQ9BY12 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.26■■■□□ 2.91
SCAPERQ9BY12 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC33.26■■■□□ 2.91
SCAPERQ9BY12 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
SCAPERQ9BY12 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
SCAPERQ9BY12 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
SCAPERQ9BY12 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
SCAPERQ9BY12 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
SCAPERQ9BY12 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
SCAPERQ9BY12 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC33.24■■■□□ 2.91
SCAPERQ9BY12 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC33.24■■■□□ 2.91
SCAPERQ9BY12 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
SCAPERQ9BY12 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
SCAPERQ9BY12 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
SCAPERQ9BY12 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
SCAPERQ9BY12 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
SCAPERQ9BY12 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
SCAPERQ9BY12 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
SCAPERQ9BY12 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC33.23■■■□□ 2.91
SCAPERQ9BY12 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
SCAPERQ9BY12 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC33.23■■■□□ 2.91
SCAPERQ9BY12 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
SCAPERQ9BY12 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
SCAPERQ9BY12 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
SCAPERQ9BY12 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
SCAPERQ9BY12 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
SCAPERQ9BY12 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC33.22■■■□□ 2.91
SCAPERQ9BY12 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
SCAPERQ9BY12 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
SCAPERQ9BY12 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
SCAPERQ9BY12 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
SCAPERQ9BY12 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
SCAPERQ9BY12 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC33.21■■■□□ 2.91
SCAPERQ9BY12 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
SCAPERQ9BY12 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
SCAPERQ9BY12 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
SCAPERQ9BY12 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.91
SCAPERQ9BY12 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
SCAPERQ9BY12 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
SCAPERQ9BY12 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
SCAPERQ9BY12 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.91
SCAPERQ9BY12 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
SCAPERQ9BY12 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
SCAPERQ9BY12 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
SCAPERQ9BY12 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
SCAPERQ9BY12 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
SCAPERQ9BY12 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC33.19■■■□□ 2.9
SCAPERQ9BY12 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC33.19■■■□□ 2.9
SCAPERQ9BY12 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC33.19■■■□□ 2.9
SCAPERQ9BY12 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.19■■■□□ 2.9
SCAPERQ9BY12 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
SCAPERQ9BY12 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms