Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY07

SLC4A5, Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A5Q9BY07 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC4A5Q9BY07 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC4A5Q9BY07 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC4A5Q9BY07 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC4A5Q9BY07 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC4A5Q9BY07 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC4A5Q9BY07 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC4A5Q9BY07 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC4A5Q9BY07 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC4A5Q9BY07 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC4A5Q9BY07 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC4A5Q9BY07 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC4A5Q9BY07 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC4A5Q9BY07 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC4A5Q9BY07 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC4A5Q9BY07 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC4A5Q9BY07 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC4A5Q9BY07 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC4A5Q9BY07 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC4A5Q9BY07 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC4A5Q9BY07 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC4A5Q9BY07 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC4A5Q9BY07 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC4A5Q9BY07 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC4A5Q9BY07 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC4A5Q9BY07 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC4A5Q9BY07 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC4A5Q9BY07 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC4A5Q9BY07 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC4A5Q9BY07 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC4A5Q9BY07 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC4A5Q9BY07 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC4A5Q9BY07 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC4A5Q9BY07 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC4A5Q9BY07 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC4A5Q9BY07 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC4A5Q9BY07 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC4A5Q9BY07 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC4A5Q9BY07 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC4A5Q9BY07 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC4A5Q9BY07 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC4A5Q9BY07 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC4A5Q9BY07 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC4A5Q9BY07 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC4A5Q9BY07 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC4A5Q9BY07 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC4A5Q9BY07 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC4A5Q9BY07 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC4A5Q9BY07 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC4A5Q9BY07 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC4A5Q9BY07 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC4A5Q9BY07 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC4A5Q9BY07 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC4A5Q9BY07 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC4A5Q9BY07 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC4A5Q9BY07 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC4A5Q9BY07 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC4A5Q9BY07 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC4A5Q9BY07 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC4A5Q9BY07 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC4A5Q9BY07 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC4A5Q9BY07 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC4A5Q9BY07 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC4A5Q9BY07 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC4A5Q9BY07 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC4A5Q9BY07 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC4A5Q9BY07 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC4A5Q9BY07 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC4A5Q9BY07 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC4A5Q9BY07 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC4A5Q9BY07 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC4A5Q9BY07 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC4A5Q9BY07 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC4A5Q9BY07 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC4A5Q9BY07 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC4A5Q9BY07 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC4A5Q9BY07 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC4A5Q9BY07 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC4A5Q9BY07 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC4A5Q9BY07 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC4A5Q9BY07 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC4A5Q9BY07 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC4A5Q9BY07 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC4A5Q9BY07 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC4A5Q9BY07 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC4A5Q9BY07 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC4A5Q9BY07 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC4A5Q9BY07 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC4A5Q9BY07 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC4A5Q9BY07 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC4A5Q9BY07 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC4A5Q9BY07 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC4A5Q9BY07 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC4A5Q9BY07 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC4A5Q9BY07 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC4A5Q9BY07 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC4A5Q9BY07 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC4A5Q9BY07 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC4A5Q9BY07 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC4A5Q9BY07 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms