Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXL7

CARD11, Caspase recruitment domain-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 1,154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARD11Q9BXL7 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
CARD11Q9BXL7 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC30.87■■■□□ 2.53
CARD11Q9BXL7 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
CARD11Q9BXL7 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
CARD11Q9BXL7 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
CARD11Q9BXL7 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
CARD11Q9BXL7 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
CARD11Q9BXL7 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
CARD11Q9BXL7 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
CARD11Q9BXL7 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
CARD11Q9BXL7 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
CARD11Q9BXL7 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
CARD11Q9BXL7 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
CARD11Q9BXL7 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
CARD11Q9BXL7 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC30.86■■■□□ 2.53
CARD11Q9BXL7 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC30.86■■■□□ 2.53
CARD11Q9BXL7 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
CARD11Q9BXL7 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
CARD11Q9BXL7 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
CARD11Q9BXL7 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
CARD11Q9BXL7 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
CARD11Q9BXL7 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
CARD11Q9BXL7 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC30.85■■■□□ 2.53
CARD11Q9BXL7 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
CARD11Q9BXL7 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
CARD11Q9BXL7 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
CARD11Q9BXL7 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC30.85■■■□□ 2.53
CARD11Q9BXL7 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
CARD11Q9BXL7 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
CARD11Q9BXL7 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC30.84■■■□□ 2.53
CARD11Q9BXL7 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
CARD11Q9BXL7 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC30.84■■■□□ 2.53
CARD11Q9BXL7 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
CARD11Q9BXL7 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
CARD11Q9BXL7 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
CARD11Q9BXL7 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
CARD11Q9BXL7 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
CARD11Q9BXL7 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
CARD11Q9BXL7 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
CARD11Q9BXL7 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
CARD11Q9BXL7 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
CARD11Q9BXL7 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.53
CARD11Q9BXL7 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
CARD11Q9BXL7 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
CARD11Q9BXL7 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
CARD11Q9BXL7 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
CARD11Q9BXL7 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
CARD11Q9BXL7 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
CARD11Q9BXL7 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC30.82■■■□□ 2.52
CARD11Q9BXL7 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
CARD11Q9BXL7 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
CARD11Q9BXL7 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
CARD11Q9BXL7 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
CARD11Q9BXL7 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
CARD11Q9BXL7 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
CARD11Q9BXL7 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
CARD11Q9BXL7 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
CARD11Q9BXL7 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
CARD11Q9BXL7 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.81■■■□□ 2.52
CARD11Q9BXL7 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
CARD11Q9BXL7 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
CARD11Q9BXL7 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
CARD11Q9BXL7 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC30.8■■■□□ 2.52
CARD11Q9BXL7 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
CARD11Q9BXL7 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
CARD11Q9BXL7 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC30.8■■■□□ 2.52
CARD11Q9BXL7 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
CARD11Q9BXL7 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
CARD11Q9BXL7 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
CARD11Q9BXL7 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
CARD11Q9BXL7 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
CARD11Q9BXL7 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
CARD11Q9BXL7 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
CARD11Q9BXL7 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
CARD11Q9BXL7 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
CARD11Q9BXL7 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
CARD11Q9BXL7 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
CARD11Q9BXL7 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
CARD11Q9BXL7 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
CARD11Q9BXL7 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
CARD11Q9BXL7 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
CARD11Q9BXL7 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
CARD11Q9BXL7 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
CARD11Q9BXL7 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
CARD11Q9BXL7 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
CARD11Q9BXL7 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC30.78■■■□□ 2.52
CARD11Q9BXL7 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
CARD11Q9BXL7 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
CARD11Q9BXL7 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
CARD11Q9BXL7 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
CARD11Q9BXL7 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
CARD11Q9BXL7 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
CARD11Q9BXL7 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
CARD11Q9BXL7 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.52
CARD11Q9BXL7 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
CARD11Q9BXL7 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
CARD11Q9BXL7 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC30.76■■■□□ 2.51
CARD11Q9BXL7 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC30.76■■■□□ 2.51
CARD11Q9BXL7 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
CARD11Q9BXL7 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms