Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW85

CCDC94, Coiled-coil domain-containing protein 94, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC94Q9BW85 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC94Q9BW85 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC94Q9BW85 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC94Q9BW85 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC94Q9BW85 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC94Q9BW85 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC94Q9BW85 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC94Q9BW85 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC94Q9BW85 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC94Q9BW85 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC94Q9BW85 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC94Q9BW85 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC94Q9BW85 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC94Q9BW85 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC94Q9BW85 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC94Q9BW85 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC94Q9BW85 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC94Q9BW85 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC94Q9BW85 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC94Q9BW85 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC94Q9BW85 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC94Q9BW85 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC94Q9BW85 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC94Q9BW85 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC94Q9BW85 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC94Q9BW85 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC94Q9BW85 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC94Q9BW85 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC94Q9BW85 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC94Q9BW85 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC94Q9BW85 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC94Q9BW85 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC94Q9BW85 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC94Q9BW85 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC94Q9BW85 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC94Q9BW85 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC94Q9BW85 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC94Q9BW85 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC94Q9BW85 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC94Q9BW85 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC94Q9BW85 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC94Q9BW85 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC94Q9BW85 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC94Q9BW85 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC94Q9BW85 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC94Q9BW85 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC94Q9BW85 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC94Q9BW85 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC94Q9BW85 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC94Q9BW85 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC94Q9BW85 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC94Q9BW85 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC94Q9BW85 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC94Q9BW85 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC94Q9BW85 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC94Q9BW85 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC94Q9BW85 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC94Q9BW85 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC94Q9BW85 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC94Q9BW85 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC94Q9BW85 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC94Q9BW85 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC94Q9BW85 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC94Q9BW85 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC94Q9BW85 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC94Q9BW85 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC94Q9BW85 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC94Q9BW85 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC94Q9BW85 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC94Q9BW85 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC94Q9BW85 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC94Q9BW85 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC94Q9BW85 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC94Q9BW85 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC94Q9BW85 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC94Q9BW85 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC94Q9BW85 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC94Q9BW85 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC94Q9BW85 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC94Q9BW85 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC94Q9BW85 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC94Q9BW85 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC94Q9BW85 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC94Q9BW85 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC94Q9BW85 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC94Q9BW85 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC94Q9BW85 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC94Q9BW85 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC94Q9BW85 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC94Q9BW85 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC94Q9BW85 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC94Q9BW85 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC94Q9BW85 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC94Q9BW85 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC94Q9BW85 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC94Q9BW85 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC94Q9BW85 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CCDC94Q9BW85 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC94Q9BW85 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC94Q9BW85 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms