Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW71

HIRIP3, HIRA-interacting protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRIP3Q9BW71 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
HIRIP3Q9BW71 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC31.38■■■□□ 2.61
HIRIP3Q9BW71 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC31.38■■■□□ 2.61
HIRIP3Q9BW71 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
HIRIP3Q9BW71 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.37■■■□□ 2.61
HIRIP3Q9BW71 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
HIRIP3Q9BW71 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
HIRIP3Q9BW71 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC31.37■■■□□ 2.61
HIRIP3Q9BW71 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
HIRIP3Q9BW71 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC31.37■■■□□ 2.61
HIRIP3Q9BW71 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
HIRIP3Q9BW71 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.37■■■□□ 2.61
HIRIP3Q9BW71 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
HIRIP3Q9BW71 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
HIRIP3Q9BW71 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
HIRIP3Q9BW71 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC31.37■■■□□ 2.61
HIRIP3Q9BW71 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.36■■■□□ 2.61
HIRIP3Q9BW71 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.36■■■□□ 2.61
HIRIP3Q9BW71 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
HIRIP3Q9BW71 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
HIRIP3Q9BW71 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC31.36■■■□□ 2.61
HIRIP3Q9BW71 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC31.36■■■□□ 2.61
HIRIP3Q9BW71 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
HIRIP3Q9BW71 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
HIRIP3Q9BW71 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC31.36■■■□□ 2.61
HIRIP3Q9BW71 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC31.36■■■□□ 2.61
HIRIP3Q9BW71 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
HIRIP3Q9BW71 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
HIRIP3Q9BW71 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
HIRIP3Q9BW71 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
HIRIP3Q9BW71 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
HIRIP3Q9BW71 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
HIRIP3Q9BW71 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC31.34■■■□□ 2.61
HIRIP3Q9BW71 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC31.34■■■□□ 2.61
HIRIP3Q9BW71 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
HIRIP3Q9BW71 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
HIRIP3Q9BW71 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC31.34■■■□□ 2.61
HIRIP3Q9BW71 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
HIRIP3Q9BW71 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC31.33■■■□□ 2.61
HIRIP3Q9BW71 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC31.33■■■□□ 2.61
HIRIP3Q9BW71 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
HIRIP3Q9BW71 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
HIRIP3Q9BW71 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
HIRIP3Q9BW71 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC31.33■■■□□ 2.61
HIRIP3Q9BW71 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
HIRIP3Q9BW71 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
HIRIP3Q9BW71 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC31.33■■■□□ 2.61
HIRIP3Q9BW71 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
HIRIP3Q9BW71 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC31.33■■■□□ 2.61
HIRIP3Q9BW71 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.33■■■□□ 2.61
HIRIP3Q9BW71 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC31.33■■■□□ 2.61
HIRIP3Q9BW71 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.61
HIRIP3Q9BW71 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
HIRIP3Q9BW71 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
HIRIP3Q9BW71 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
HIRIP3Q9BW71 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC31.32■■■□□ 2.6
HIRIP3Q9BW71 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
HIRIP3Q9BW71 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
HIRIP3Q9BW71 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC31.32■■■□□ 2.6
HIRIP3Q9BW71 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.31■■■□□ 2.6
HIRIP3Q9BW71 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.31■■■□□ 2.6
HIRIP3Q9BW71 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC31.31■■■□□ 2.6
HIRIP3Q9BW71 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
HIRIP3Q9BW71 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
HIRIP3Q9BW71 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
HIRIP3Q9BW71 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.31■■■□□ 2.6
HIRIP3Q9BW71 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC31.31■■■□□ 2.6
HIRIP3Q9BW71 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
HIRIP3Q9BW71 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC31.31■■■□□ 2.6
HIRIP3Q9BW71 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
HIRIP3Q9BW71 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC31.3■■■□□ 2.6
HIRIP3Q9BW71 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
HIRIP3Q9BW71 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
HIRIP3Q9BW71 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC31.3■■■□□ 2.6
HIRIP3Q9BW71 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC31.3■■■□□ 2.6
HIRIP3Q9BW71 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC31.3■■■□□ 2.6
HIRIP3Q9BW71 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC31.3■■■□□ 2.6
HIRIP3Q9BW71 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC31.3■■■□□ 2.6
HIRIP3Q9BW71 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC31.3■■■□□ 2.6
HIRIP3Q9BW71 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC31.3■■■□□ 2.6
HIRIP3Q9BW71 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC31.3■■■□□ 2.6
HIRIP3Q9BW71 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC31.3■■■□□ 2.6
HIRIP3Q9BW71 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC31.3■■■□□ 2.6
HIRIP3Q9BW71 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC31.3■■■□□ 2.6
HIRIP3Q9BW71 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC31.29■■■□□ 2.6
HIRIP3Q9BW71 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
HIRIP3Q9BW71 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
HIRIP3Q9BW71 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC31.29■■■□□ 2.6
HIRIP3Q9BW71 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
HIRIP3Q9BW71 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC31.29■■■□□ 2.6
HIRIP3Q9BW71 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC31.29■■■□□ 2.6
HIRIP3Q9BW71 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC31.29■■■□□ 2.6
HIRIP3Q9BW71 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
HIRIP3Q9BW71 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
HIRIP3Q9BW71 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.29■■■□□ 2.6
HIRIP3Q9BW71 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC31.29■■■□□ 2.6
HIRIP3Q9BW71 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
HIRIP3Q9BW71 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
HIRIP3Q9BW71 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
HIRIP3Q9BW71 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 132.9 ms