Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW27

NUP85, Nuclear pore complex protein Nup85, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP85Q9BW27 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NUP85Q9BW27 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
NUP85Q9BW27 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NUP85Q9BW27 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
NUP85Q9BW27 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NUP85Q9BW27 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
NUP85Q9BW27 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NUP85Q9BW27 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NUP85Q9BW27 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NUP85Q9BW27 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NUP85Q9BW27 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
NUP85Q9BW27 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
NUP85Q9BW27 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
NUP85Q9BW27 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
NUP85Q9BW27 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NUP85Q9BW27 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NUP85Q9BW27 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NUP85Q9BW27 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NUP85Q9BW27 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NUP85Q9BW27 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NUP85Q9BW27 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NUP85Q9BW27 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NUP85Q9BW27 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NUP85Q9BW27 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NUP85Q9BW27 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NUP85Q9BW27 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NUP85Q9BW27 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NUP85Q9BW27 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NUP85Q9BW27 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NUP85Q9BW27 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
NUP85Q9BW27 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NUP85Q9BW27 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NUP85Q9BW27 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NUP85Q9BW27 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NUP85Q9BW27 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NUP85Q9BW27 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NUP85Q9BW27 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NUP85Q9BW27 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NUP85Q9BW27 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NUP85Q9BW27 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NUP85Q9BW27 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
NUP85Q9BW27 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NUP85Q9BW27 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NUP85Q9BW27 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NUP85Q9BW27 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NUP85Q9BW27 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NUP85Q9BW27 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NUP85Q9BW27 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
NUP85Q9BW27 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NUP85Q9BW27 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NUP85Q9BW27 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NUP85Q9BW27 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NUP85Q9BW27 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NUP85Q9BW27 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NUP85Q9BW27 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NUP85Q9BW27 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NUP85Q9BW27 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NUP85Q9BW27 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NUP85Q9BW27 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NUP85Q9BW27 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NUP85Q9BW27 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NUP85Q9BW27 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NUP85Q9BW27 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NUP85Q9BW27 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NUP85Q9BW27 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NUP85Q9BW27 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NUP85Q9BW27 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NUP85Q9BW27 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NUP85Q9BW27 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NUP85Q9BW27 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NUP85Q9BW27 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
NUP85Q9BW27 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NUP85Q9BW27 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NUP85Q9BW27 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NUP85Q9BW27 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NUP85Q9BW27 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NUP85Q9BW27 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NUP85Q9BW27 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NUP85Q9BW27 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NUP85Q9BW27 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NUP85Q9BW27 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NUP85Q9BW27 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NUP85Q9BW27 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
NUP85Q9BW27 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NUP85Q9BW27 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NUP85Q9BW27 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NUP85Q9BW27 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NUP85Q9BW27 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
NUP85Q9BW27 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23■■□□□ 1.27
NUP85Q9BW27 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NUP85Q9BW27 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NUP85Q9BW27 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NUP85Q9BW27 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
NUP85Q9BW27 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NUP85Q9BW27 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NUP85Q9BW27 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NUP85Q9BW27 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
NUP85Q9BW27 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NUP85Q9BW27 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NUP85Q9BW27 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms