Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVL2

NUP58, Nucleoporin p58/p45, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP58Q9BVL2 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NUP58Q9BVL2 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NUP58Q9BVL2 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
NUP58Q9BVL2 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NUP58Q9BVL2 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NUP58Q9BVL2 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NUP58Q9BVL2 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NUP58Q9BVL2 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NUP58Q9BVL2 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NUP58Q9BVL2 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NUP58Q9BVL2 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NUP58Q9BVL2 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NUP58Q9BVL2 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NUP58Q9BVL2 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NUP58Q9BVL2 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
NUP58Q9BVL2 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NUP58Q9BVL2 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NUP58Q9BVL2 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NUP58Q9BVL2 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NUP58Q9BVL2 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NUP58Q9BVL2 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NUP58Q9BVL2 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NUP58Q9BVL2 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NUP58Q9BVL2 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NUP58Q9BVL2 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NUP58Q9BVL2 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NUP58Q9BVL2 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NUP58Q9BVL2 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NUP58Q9BVL2 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NUP58Q9BVL2 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NUP58Q9BVL2 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NUP58Q9BVL2 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
NUP58Q9BVL2 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NUP58Q9BVL2 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NUP58Q9BVL2 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NUP58Q9BVL2 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NUP58Q9BVL2 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NUP58Q9BVL2 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NUP58Q9BVL2 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NUP58Q9BVL2 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NUP58Q9BVL2 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NUP58Q9BVL2 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NUP58Q9BVL2 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NUP58Q9BVL2 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NUP58Q9BVL2 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NUP58Q9BVL2 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NUP58Q9BVL2 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NUP58Q9BVL2 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NUP58Q9BVL2 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NUP58Q9BVL2 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NUP58Q9BVL2 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NUP58Q9BVL2 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NUP58Q9BVL2 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NUP58Q9BVL2 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NUP58Q9BVL2 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NUP58Q9BVL2 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NUP58Q9BVL2 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NUP58Q9BVL2 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NUP58Q9BVL2 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NUP58Q9BVL2 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NUP58Q9BVL2 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NUP58Q9BVL2 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NUP58Q9BVL2 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
NUP58Q9BVL2 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NUP58Q9BVL2 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NUP58Q9BVL2 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NUP58Q9BVL2 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NUP58Q9BVL2 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NUP58Q9BVL2 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NUP58Q9BVL2 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NUP58Q9BVL2 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NUP58Q9BVL2 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NUP58Q9BVL2 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NUP58Q9BVL2 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NUP58Q9BVL2 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NUP58Q9BVL2 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NUP58Q9BVL2 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NUP58Q9BVL2 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
NUP58Q9BVL2 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NUP58Q9BVL2 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NUP58Q9BVL2 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NUP58Q9BVL2 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NUP58Q9BVL2 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NUP58Q9BVL2 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NUP58Q9BVL2 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NUP58Q9BVL2 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NUP58Q9BVL2 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NUP58Q9BVL2 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NUP58Q9BVL2 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NUP58Q9BVL2 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
NUP58Q9BVL2 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NUP58Q9BVL2 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NUP58Q9BVL2 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NUP58Q9BVL2 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NUP58Q9BVL2 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NUP58Q9BVL2 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NUP58Q9BVL2 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NUP58Q9BVL2 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NUP58Q9BVL2 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NUP58Q9BVL2 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms