Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUF5

TUBB6, Tubulin beta-6 chain, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB6Q9BUF5 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
TUBB6Q9BUF5 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TUBB6Q9BUF5 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
TUBB6Q9BUF5 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TUBB6Q9BUF5 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TUBB6Q9BUF5 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TUBB6Q9BUF5 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TUBB6Q9BUF5 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TUBB6Q9BUF5 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TUBB6Q9BUF5 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TUBB6Q9BUF5 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TUBB6Q9BUF5 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TUBB6Q9BUF5 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TUBB6Q9BUF5 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TUBB6Q9BUF5 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TUBB6Q9BUF5 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TUBB6Q9BUF5 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TUBB6Q9BUF5 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TUBB6Q9BUF5 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TUBB6Q9BUF5 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TUBB6Q9BUF5 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TUBB6Q9BUF5 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
TUBB6Q9BUF5 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
TUBB6Q9BUF5 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TUBB6Q9BUF5 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TUBB6Q9BUF5 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TUBB6Q9BUF5 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TUBB6Q9BUF5 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TUBB6Q9BUF5 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TUBB6Q9BUF5 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TUBB6Q9BUF5 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TUBB6Q9BUF5 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TUBB6Q9BUF5 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TUBB6Q9BUF5 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TUBB6Q9BUF5 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TUBB6Q9BUF5 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TUBB6Q9BUF5 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TUBB6Q9BUF5 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TUBB6Q9BUF5 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TUBB6Q9BUF5 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
TUBB6Q9BUF5 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TUBB6Q9BUF5 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TUBB6Q9BUF5 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TUBB6Q9BUF5 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TUBB6Q9BUF5 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TUBB6Q9BUF5 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TUBB6Q9BUF5 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TUBB6Q9BUF5 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TUBB6Q9BUF5 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TUBB6Q9BUF5 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TUBB6Q9BUF5 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TUBB6Q9BUF5 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TUBB6Q9BUF5 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TUBB6Q9BUF5 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TUBB6Q9BUF5 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TUBB6Q9BUF5 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TUBB6Q9BUF5 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TUBB6Q9BUF5 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TUBB6Q9BUF5 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TUBB6Q9BUF5 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TUBB6Q9BUF5 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TUBB6Q9BUF5 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TUBB6Q9BUF5 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TUBB6Q9BUF5 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TUBB6Q9BUF5 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TUBB6Q9BUF5 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TUBB6Q9BUF5 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TUBB6Q9BUF5 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TUBB6Q9BUF5 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TUBB6Q9BUF5 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TUBB6Q9BUF5 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TUBB6Q9BUF5 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TUBB6Q9BUF5 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
TUBB6Q9BUF5 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TUBB6Q9BUF5 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TUBB6Q9BUF5 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
TUBB6Q9BUF5 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TUBB6Q9BUF5 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
TUBB6Q9BUF5 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
TUBB6Q9BUF5 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
TUBB6Q9BUF5 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
TUBB6Q9BUF5 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TUBB6Q9BUF5 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TUBB6Q9BUF5 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TUBB6Q9BUF5 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TUBB6Q9BUF5 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TUBB6Q9BUF5 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TUBB6Q9BUF5 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TUBB6Q9BUF5 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TUBB6Q9BUF5 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TUBB6Q9BUF5 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TUBB6Q9BUF5 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TUBB6Q9BUF5 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TUBB6Q9BUF5 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TUBB6Q9BUF5 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TUBB6Q9BUF5 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TUBB6Q9BUF5 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TUBB6Q9BUF5 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TUBB6Q9BUF5 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TUBB6Q9BUF5 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms