Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTD1

SHANK2-AS3, Putative uncharacterized protein SHANK2-AS3, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHANK2-AS3Q9BTD1 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SHANK2-AS3Q9BTD1 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SHANK2-AS3Q9BTD1 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SHANK2-AS3Q9BTD1 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SHANK2-AS3Q9BTD1 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SHANK2-AS3Q9BTD1 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SHANK2-AS3Q9BTD1 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SHANK2-AS3Q9BTD1 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SHANK2-AS3Q9BTD1 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SHANK2-AS3Q9BTD1 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SHANK2-AS3Q9BTD1 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SHANK2-AS3Q9BTD1 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SHANK2-AS3Q9BTD1 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SHANK2-AS3Q9BTD1 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SHANK2-AS3Q9BTD1 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SHANK2-AS3Q9BTD1 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SHANK2-AS3Q9BTD1 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SHANK2-AS3Q9BTD1 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SHANK2-AS3Q9BTD1 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SHANK2-AS3Q9BTD1 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SHANK2-AS3Q9BTD1 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SHANK2-AS3Q9BTD1 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SHANK2-AS3Q9BTD1 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SHANK2-AS3Q9BTD1 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SHANK2-AS3Q9BTD1 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SHANK2-AS3Q9BTD1 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SHANK2-AS3Q9BTD1 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SHANK2-AS3Q9BTD1 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SHANK2-AS3Q9BTD1 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SHANK2-AS3Q9BTD1 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SHANK2-AS3Q9BTD1 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SHANK2-AS3Q9BTD1 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SHANK2-AS3Q9BTD1 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SHANK2-AS3Q9BTD1 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SHANK2-AS3Q9BTD1 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SHANK2-AS3Q9BTD1 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SHANK2-AS3Q9BTD1 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SHANK2-AS3Q9BTD1 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SHANK2-AS3Q9BTD1 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SHANK2-AS3Q9BTD1 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
SHANK2-AS3Q9BTD1 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SHANK2-AS3Q9BTD1 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SHANK2-AS3Q9BTD1 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
SHANK2-AS3Q9BTD1 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SHANK2-AS3Q9BTD1 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SHANK2-AS3Q9BTD1 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SHANK2-AS3Q9BTD1 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SHANK2-AS3Q9BTD1 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SHANK2-AS3Q9BTD1 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SHANK2-AS3Q9BTD1 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SHANK2-AS3Q9BTD1 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SHANK2-AS3Q9BTD1 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SHANK2-AS3Q9BTD1 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SHANK2-AS3Q9BTD1 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SHANK2-AS3Q9BTD1 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SHANK2-AS3Q9BTD1 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SHANK2-AS3Q9BTD1 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SHANK2-AS3Q9BTD1 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SHANK2-AS3Q9BTD1 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SHANK2-AS3Q9BTD1 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SHANK2-AS3Q9BTD1 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SHANK2-AS3Q9BTD1 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SHANK2-AS3Q9BTD1 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SHANK2-AS3Q9BTD1 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SHANK2-AS3Q9BTD1 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SHANK2-AS3Q9BTD1 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SHANK2-AS3Q9BTD1 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SHANK2-AS3Q9BTD1 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SHANK2-AS3Q9BTD1 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SHANK2-AS3Q9BTD1 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SHANK2-AS3Q9BTD1 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SHANK2-AS3Q9BTD1 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SHANK2-AS3Q9BTD1 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SHANK2-AS3Q9BTD1 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SHANK2-AS3Q9BTD1 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SHANK2-AS3Q9BTD1 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SHANK2-AS3Q9BTD1 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SHANK2-AS3Q9BTD1 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SHANK2-AS3Q9BTD1 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SHANK2-AS3Q9BTD1 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SHANK2-AS3Q9BTD1 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SHANK2-AS3Q9BTD1 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SHANK2-AS3Q9BTD1 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SHANK2-AS3Q9BTD1 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SHANK2-AS3Q9BTD1 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SHANK2-AS3Q9BTD1 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SHANK2-AS3Q9BTD1 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SHANK2-AS3Q9BTD1 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SHANK2-AS3Q9BTD1 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SHANK2-AS3Q9BTD1 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SHANK2-AS3Q9BTD1 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SHANK2-AS3Q9BTD1 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SHANK2-AS3Q9BTD1 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SHANK2-AS3Q9BTD1 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SHANK2-AS3Q9BTD1 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms