Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSW2

CRACR2A, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 4B, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRACR2AQ9BSW2 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CRACR2AQ9BSW2 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CRACR2AQ9BSW2 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
CRACR2AQ9BSW2 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CRACR2AQ9BSW2 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CRACR2AQ9BSW2 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CRACR2AQ9BSW2 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CRACR2AQ9BSW2 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CRACR2AQ9BSW2 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CRACR2AQ9BSW2 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CRACR2AQ9BSW2 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CRACR2AQ9BSW2 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CRACR2AQ9BSW2 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CRACR2AQ9BSW2 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CRACR2AQ9BSW2 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CRACR2AQ9BSW2 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CRACR2AQ9BSW2 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CRACR2AQ9BSW2 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CRACR2AQ9BSW2 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CRACR2AQ9BSW2 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CRACR2AQ9BSW2 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CRACR2AQ9BSW2 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CRACR2AQ9BSW2 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CRACR2AQ9BSW2 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CRACR2AQ9BSW2 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CRACR2AQ9BSW2 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CRACR2AQ9BSW2 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CRACR2AQ9BSW2 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CRACR2AQ9BSW2 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CRACR2AQ9BSW2 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CRACR2AQ9BSW2 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CRACR2AQ9BSW2 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CRACR2AQ9BSW2 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CRACR2AQ9BSW2 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CRACR2AQ9BSW2 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CRACR2AQ9BSW2 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CRACR2AQ9BSW2 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CRACR2AQ9BSW2 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CRACR2AQ9BSW2 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CRACR2AQ9BSW2 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CRACR2AQ9BSW2 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CRACR2AQ9BSW2 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CRACR2AQ9BSW2 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CRACR2AQ9BSW2 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CRACR2AQ9BSW2 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CRACR2AQ9BSW2 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CRACR2AQ9BSW2 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CRACR2AQ9BSW2 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CRACR2AQ9BSW2 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CRACR2AQ9BSW2 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CRACR2AQ9BSW2 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CRACR2AQ9BSW2 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CRACR2AQ9BSW2 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CRACR2AQ9BSW2 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CRACR2AQ9BSW2 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CRACR2AQ9BSW2 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CRACR2AQ9BSW2 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CRACR2AQ9BSW2 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CRACR2AQ9BSW2 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CRACR2AQ9BSW2 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CRACR2AQ9BSW2 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CRACR2AQ9BSW2 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CRACR2AQ9BSW2 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CRACR2AQ9BSW2 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CRACR2AQ9BSW2 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CRACR2AQ9BSW2 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CRACR2AQ9BSW2 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CRACR2AQ9BSW2 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CRACR2AQ9BSW2 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CRACR2AQ9BSW2 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CRACR2AQ9BSW2 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CRACR2AQ9BSW2 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CRACR2AQ9BSW2 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CRACR2AQ9BSW2 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CRACR2AQ9BSW2 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CRACR2AQ9BSW2 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CRACR2AQ9BSW2 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CRACR2AQ9BSW2 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CRACR2AQ9BSW2 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CRACR2AQ9BSW2 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CRACR2AQ9BSW2 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CRACR2AQ9BSW2 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CRACR2AQ9BSW2 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CRACR2AQ9BSW2 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CRACR2AQ9BSW2 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CRACR2AQ9BSW2 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CRACR2AQ9BSW2 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CRACR2AQ9BSW2 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CRACR2AQ9BSW2 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CRACR2AQ9BSW2 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
CRACR2AQ9BSW2 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CRACR2AQ9BSW2 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CRACR2AQ9BSW2 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CRACR2AQ9BSW2 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CRACR2AQ9BSW2 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CRACR2AQ9BSW2 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CRACR2AQ9BSW2 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
CRACR2AQ9BSW2 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CRACR2AQ9BSW2 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CRACR2AQ9BSW2 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms