Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRA2

TXNDC17, Thioredoxin domain-containing protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNDC17Q9BRA2 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TXNDC17Q9BRA2 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TXNDC17Q9BRA2 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TXNDC17Q9BRA2 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TXNDC17Q9BRA2 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TXNDC17Q9BRA2 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TXNDC17Q9BRA2 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TXNDC17Q9BRA2 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TXNDC17Q9BRA2 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TXNDC17Q9BRA2 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TXNDC17Q9BRA2 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TXNDC17Q9BRA2 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TXNDC17Q9BRA2 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
TXNDC17Q9BRA2 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
TXNDC17Q9BRA2 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TXNDC17Q9BRA2 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TXNDC17Q9BRA2 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TXNDC17Q9BRA2 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TXNDC17Q9BRA2 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TXNDC17Q9BRA2 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TXNDC17Q9BRA2 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TXNDC17Q9BRA2 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TXNDC17Q9BRA2 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TXNDC17Q9BRA2 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TXNDC17Q9BRA2 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TXNDC17Q9BRA2 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TXNDC17Q9BRA2 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TXNDC17Q9BRA2 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TXNDC17Q9BRA2 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TXNDC17Q9BRA2 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TXNDC17Q9BRA2 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TXNDC17Q9BRA2 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TXNDC17Q9BRA2 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TXNDC17Q9BRA2 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TXNDC17Q9BRA2 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TXNDC17Q9BRA2 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TXNDC17Q9BRA2 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TXNDC17Q9BRA2 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TXNDC17Q9BRA2 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TXNDC17Q9BRA2 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
TXNDC17Q9BRA2 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TXNDC17Q9BRA2 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TXNDC17Q9BRA2 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TXNDC17Q9BRA2 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TXNDC17Q9BRA2 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TXNDC17Q9BRA2 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TXNDC17Q9BRA2 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TXNDC17Q9BRA2 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TXNDC17Q9BRA2 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TXNDC17Q9BRA2 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TXNDC17Q9BRA2 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TXNDC17Q9BRA2 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TXNDC17Q9BRA2 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TXNDC17Q9BRA2 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TXNDC17Q9BRA2 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
TXNDC17Q9BRA2 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TXNDC17Q9BRA2 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TXNDC17Q9BRA2 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TXNDC17Q9BRA2 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TXNDC17Q9BRA2 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TXNDC17Q9BRA2 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TXNDC17Q9BRA2 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TXNDC17Q9BRA2 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TXNDC17Q9BRA2 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TXNDC17Q9BRA2 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TXNDC17Q9BRA2 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TXNDC17Q9BRA2 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TXNDC17Q9BRA2 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TXNDC17Q9BRA2 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TXNDC17Q9BRA2 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TXNDC17Q9BRA2 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TXNDC17Q9BRA2 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TXNDC17Q9BRA2 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TXNDC17Q9BRA2 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TXNDC17Q9BRA2 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TXNDC17Q9BRA2 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TXNDC17Q9BRA2 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TXNDC17Q9BRA2 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TXNDC17Q9BRA2 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
TXNDC17Q9BRA2 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TXNDC17Q9BRA2 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TXNDC17Q9BRA2 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TXNDC17Q9BRA2 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TXNDC17Q9BRA2 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TXNDC17Q9BRA2 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TXNDC17Q9BRA2 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TXNDC17Q9BRA2 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TXNDC17Q9BRA2 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TXNDC17Q9BRA2 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TXNDC17Q9BRA2 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TXNDC17Q9BRA2 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TXNDC17Q9BRA2 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TXNDC17Q9BRA2 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TXNDC17Q9BRA2 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TXNDC17Q9BRA2 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TXNDC17Q9BRA2 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TXNDC17Q9BRA2 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TXNDC17Q9BRA2 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TXNDC17Q9BRA2 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TXNDC17Q9BRA2 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms