Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQP9

BPIFA3, BPI fold-containing family A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPIFA3Q9BQP9 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BPIFA3Q9BQP9 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BPIFA3Q9BQP9 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
BPIFA3Q9BQP9 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BPIFA3Q9BQP9 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
BPIFA3Q9BQP9 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BPIFA3Q9BQP9 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
BPIFA3Q9BQP9 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.47
BPIFA3Q9BQP9 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
BPIFA3Q9BQP9 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
BPIFA3Q9BQP9 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
BPIFA3Q9BQP9 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
BPIFA3Q9BQP9 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
BPIFA3Q9BQP9 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
BPIFA3Q9BQP9 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
BPIFA3Q9BQP9 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BPIFA3Q9BQP9 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
BPIFA3Q9BQP9 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
BPIFA3Q9BQP9 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
BPIFA3Q9BQP9 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
BPIFA3Q9BQP9 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BPIFA3Q9BQP9 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BPIFA3Q9BQP9 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
BPIFA3Q9BQP9 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
BPIFA3Q9BQP9 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
BPIFA3Q9BQP9 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
BPIFA3Q9BQP9 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
BPIFA3Q9BQP9 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BPIFA3Q9BQP9 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
BPIFA3Q9BQP9 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
BPIFA3Q9BQP9 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
BPIFA3Q9BQP9 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
BPIFA3Q9BQP9 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BPIFA3Q9BQP9 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BPIFA3Q9BQP9 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BPIFA3Q9BQP9 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
BPIFA3Q9BQP9 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BPIFA3Q9BQP9 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BPIFA3Q9BQP9 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BPIFA3Q9BQP9 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
BPIFA3Q9BQP9 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
BPIFA3Q9BQP9 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
BPIFA3Q9BQP9 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
BPIFA3Q9BQP9 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
BPIFA3Q9BQP9 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BPIFA3Q9BQP9 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
BPIFA3Q9BQP9 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BPIFA3Q9BQP9 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
BPIFA3Q9BQP9 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
BPIFA3Q9BQP9 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
BPIFA3Q9BQP9 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
BPIFA3Q9BQP9 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BPIFA3Q9BQP9 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BPIFA3Q9BQP9 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BPIFA3Q9BQP9 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BPIFA3Q9BQP9 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
BPIFA3Q9BQP9 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
BPIFA3Q9BQP9 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
BPIFA3Q9BQP9 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BPIFA3Q9BQP9 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
BPIFA3Q9BQP9 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
BPIFA3Q9BQP9 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BPIFA3Q9BQP9 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BPIFA3Q9BQP9 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BPIFA3Q9BQP9 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BPIFA3Q9BQP9 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
BPIFA3Q9BQP9 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
BPIFA3Q9BQP9 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
BPIFA3Q9BQP9 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
BPIFA3Q9BQP9 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BPIFA3Q9BQP9 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BPIFA3Q9BQP9 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
BPIFA3Q9BQP9 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BPIFA3Q9BQP9 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BPIFA3Q9BQP9 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
BPIFA3Q9BQP9 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
BPIFA3Q9BQP9 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
BPIFA3Q9BQP9 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
BPIFA3Q9BQP9 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
BPIFA3Q9BQP9 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
BPIFA3Q9BQP9 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
BPIFA3Q9BQP9 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
BPIFA3Q9BQP9 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
BPIFA3Q9BQP9 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
BPIFA3Q9BQP9 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
BPIFA3Q9BQP9 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
BPIFA3Q9BQP9 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
BPIFA3Q9BQP9 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
BPIFA3Q9BQP9 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
BPIFA3Q9BQP9 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BPIFA3Q9BQP9 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
BPIFA3Q9BQP9 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
BPIFA3Q9BQP9 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
BPIFA3Q9BQP9 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
BPIFA3Q9BQP9 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
BPIFA3Q9BQP9 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BPIFA3Q9BQP9 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
BPIFA3Q9BQP9 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
BPIFA3Q9BQP9 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BPIFA3Q9BQP9 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms