Protein–RNA interactions for Protein: Q99966

CITED1, Cbp/p300-interacting transactivator 1, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED1Q99966 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CITED1Q99966 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CITED1Q99966 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CITED1Q99966 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CITED1Q99966 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CITED1Q99966 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CITED1Q99966 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CITED1Q99966 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CITED1Q99966 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CITED1Q99966 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CITED1Q99966 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CITED1Q99966 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CITED1Q99966 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CITED1Q99966 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CITED1Q99966 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CITED1Q99966 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CITED1Q99966 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CITED1Q99966 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CITED1Q99966 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CITED1Q99966 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CITED1Q99966 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CITED1Q99966 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CITED1Q99966 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CITED1Q99966 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CITED1Q99966 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CITED1Q99966 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CITED1Q99966 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CITED1Q99966 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CITED1Q99966 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CITED1Q99966 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CITED1Q99966 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CITED1Q99966 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CITED1Q99966 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CITED1Q99966 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CITED1Q99966 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CITED1Q99966 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CITED1Q99966 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CITED1Q99966 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CITED1Q99966 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CITED1Q99966 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CITED1Q99966 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CITED1Q99966 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CITED1Q99966 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CITED1Q99966 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CITED1Q99966 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CITED1Q99966 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CITED1Q99966 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CITED1Q99966 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CITED1Q99966 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CITED1Q99966 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CITED1Q99966 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CITED1Q99966 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CITED1Q99966 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CITED1Q99966 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CITED1Q99966 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CITED1Q99966 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CITED1Q99966 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CITED1Q99966 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CITED1Q99966 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CITED1Q99966 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CITED1Q99966 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CITED1Q99966 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CITED1Q99966 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
CITED1Q99966 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CITED1Q99966 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
CITED1Q99966 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CITED1Q99966 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CITED1Q99966 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CITED1Q99966 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CITED1Q99966 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CITED1Q99966 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CITED1Q99966 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CITED1Q99966 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CITED1Q99966 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CITED1Q99966 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CITED1Q99966 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CITED1Q99966 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CITED1Q99966 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CITED1Q99966 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CITED1Q99966 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CITED1Q99966 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CITED1Q99966 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CITED1Q99966 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CITED1Q99966 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CITED1Q99966 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CITED1Q99966 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CITED1Q99966 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CITED1Q99966 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CITED1Q99966 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CITED1Q99966 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CITED1Q99966 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CITED1Q99966 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CITED1Q99966 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CITED1Q99966 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CITED1Q99966 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CITED1Q99966 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CITED1Q99966 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CITED1Q99966 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CITED1Q99966 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CITED1Q99966 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms