Protein–RNA interactions for Protein: Q99963

SH3GL3, Endophilin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3GL3Q99963 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SH3GL3Q99963 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SH3GL3Q99963 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SH3GL3Q99963 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SH3GL3Q99963 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SH3GL3Q99963 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SH3GL3Q99963 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SH3GL3Q99963 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SH3GL3Q99963 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SH3GL3Q99963 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
SH3GL3Q99963 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SH3GL3Q99963 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SH3GL3Q99963 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SH3GL3Q99963 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SH3GL3Q99963 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SH3GL3Q99963 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SH3GL3Q99963 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SH3GL3Q99963 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SH3GL3Q99963 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SH3GL3Q99963 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SH3GL3Q99963 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SH3GL3Q99963 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SH3GL3Q99963 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SH3GL3Q99963 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
SH3GL3Q99963 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SH3GL3Q99963 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SH3GL3Q99963 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SH3GL3Q99963 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SH3GL3Q99963 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SH3GL3Q99963 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SH3GL3Q99963 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SH3GL3Q99963 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SH3GL3Q99963 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SH3GL3Q99963 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SH3GL3Q99963 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SH3GL3Q99963 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SH3GL3Q99963 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SH3GL3Q99963 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SH3GL3Q99963 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SH3GL3Q99963 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SH3GL3Q99963 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SH3GL3Q99963 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SH3GL3Q99963 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SH3GL3Q99963 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SH3GL3Q99963 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SH3GL3Q99963 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SH3GL3Q99963 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
SH3GL3Q99963 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SH3GL3Q99963 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SH3GL3Q99963 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SH3GL3Q99963 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SH3GL3Q99963 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SH3GL3Q99963 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SH3GL3Q99963 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SH3GL3Q99963 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SH3GL3Q99963 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SH3GL3Q99963 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SH3GL3Q99963 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SH3GL3Q99963 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SH3GL3Q99963 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SH3GL3Q99963 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SH3GL3Q99963 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
SH3GL3Q99963 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SH3GL3Q99963 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SH3GL3Q99963 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SH3GL3Q99963 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SH3GL3Q99963 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SH3GL3Q99963 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SH3GL3Q99963 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SH3GL3Q99963 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SH3GL3Q99963 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SH3GL3Q99963 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SH3GL3Q99963 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SH3GL3Q99963 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SH3GL3Q99963 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SH3GL3Q99963 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SH3GL3Q99963 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SH3GL3Q99963 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SH3GL3Q99963 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SH3GL3Q99963 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SH3GL3Q99963 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SH3GL3Q99963 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SH3GL3Q99963 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SH3GL3Q99963 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SH3GL3Q99963 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SH3GL3Q99963 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
SH3GL3Q99963 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SH3GL3Q99963 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SH3GL3Q99963 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SH3GL3Q99963 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SH3GL3Q99963 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SH3GL3Q99963 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SH3GL3Q99963 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SH3GL3Q99963 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SH3GL3Q99963 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SH3GL3Q99963 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SH3GL3Q99963 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SH3GL3Q99963 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SH3GL3Q99963 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SH3GL3Q99963 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms