Protein–RNA interactions for Protein: Q99956

DUSP9, Dual specificity protein phosphatase 9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP9Q99956 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DUSP9Q99956 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DUSP9Q99956 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DUSP9Q99956 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DUSP9Q99956 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DUSP9Q99956 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DUSP9Q99956 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DUSP9Q99956 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DUSP9Q99956 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DUSP9Q99956 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
DUSP9Q99956 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DUSP9Q99956 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DUSP9Q99956 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
DUSP9Q99956 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DUSP9Q99956 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DUSP9Q99956 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
DUSP9Q99956 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DUSP9Q99956 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
DUSP9Q99956 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
DUSP9Q99956 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
DUSP9Q99956 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
DUSP9Q99956 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
DUSP9Q99956 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DUSP9Q99956 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DUSP9Q99956 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DUSP9Q99956 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DUSP9Q99956 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DUSP9Q99956 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DUSP9Q99956 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DUSP9Q99956 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DUSP9Q99956 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DUSP9Q99956 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DUSP9Q99956 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DUSP9Q99956 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DUSP9Q99956 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DUSP9Q99956 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DUSP9Q99956 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DUSP9Q99956 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DUSP9Q99956 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DUSP9Q99956 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DUSP9Q99956 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DUSP9Q99956 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
DUSP9Q99956 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DUSP9Q99956 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DUSP9Q99956 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DUSP9Q99956 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DUSP9Q99956 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DUSP9Q99956 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DUSP9Q99956 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DUSP9Q99956 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DUSP9Q99956 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DUSP9Q99956 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DUSP9Q99956 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DUSP9Q99956 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DUSP9Q99956 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DUSP9Q99956 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DUSP9Q99956 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC24■■□□□ 1.43
DUSP9Q99956 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
DUSP9Q99956 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DUSP9Q99956 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
DUSP9Q99956 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
DUSP9Q99956 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
DUSP9Q99956 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
DUSP9Q99956 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DUSP9Q99956 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
DUSP9Q99956 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
DUSP9Q99956 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DUSP9Q99956 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DUSP9Q99956 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DUSP9Q99956 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DUSP9Q99956 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DUSP9Q99956 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DUSP9Q99956 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DUSP9Q99956 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DUSP9Q99956 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DUSP9Q99956 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
DUSP9Q99956 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DUSP9Q99956 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DUSP9Q99956 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DUSP9Q99956 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DUSP9Q99956 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
DUSP9Q99956 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DUSP9Q99956 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
DUSP9Q99956 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DUSP9Q99956 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
DUSP9Q99956 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
DUSP9Q99956 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
DUSP9Q99956 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
DUSP9Q99956 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
DUSP9Q99956 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
DUSP9Q99956 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
DUSP9Q99956 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
DUSP9Q99956 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
DUSP9Q99956 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
DUSP9Q99956 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DUSP9Q99956 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
DUSP9Q99956 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
DUSP9Q99956 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
DUSP9Q99956 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
DUSP9Q99956 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms