Protein–RNA interactions for Protein: Q99708

RBBP8, DNA endonuclease RBBP8, humanhuman

Predictions only

Length 897 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP8Q99708 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RBBP8Q99708 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RBBP8Q99708 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RBBP8Q99708 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RBBP8Q99708 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RBBP8Q99708 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RBBP8Q99708 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RBBP8Q99708 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RBBP8Q99708 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RBBP8Q99708 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RBBP8Q99708 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RBBP8Q99708 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RBBP8Q99708 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RBBP8Q99708 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RBBP8Q99708 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RBBP8Q99708 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RBBP8Q99708 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RBBP8Q99708 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RBBP8Q99708 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RBBP8Q99708 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RBBP8Q99708 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RBBP8Q99708 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RBBP8Q99708 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
RBBP8Q99708 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RBBP8Q99708 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
RBBP8Q99708 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RBBP8Q99708 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RBBP8Q99708 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
RBBP8Q99708 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
RBBP8Q99708 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
RBBP8Q99708 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
RBBP8Q99708 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RBBP8Q99708 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RBBP8Q99708 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RBBP8Q99708 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RBBP8Q99708 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RBBP8Q99708 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RBBP8Q99708 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RBBP8Q99708 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RBBP8Q99708 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RBBP8Q99708 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RBBP8Q99708 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RBBP8Q99708 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RBBP8Q99708 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RBBP8Q99708 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RBBP8Q99708 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RBBP8Q99708 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RBBP8Q99708 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RBBP8Q99708 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RBBP8Q99708 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RBBP8Q99708 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RBBP8Q99708 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RBBP8Q99708 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RBBP8Q99708 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RBBP8Q99708 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RBBP8Q99708 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RBBP8Q99708 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RBBP8Q99708 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
RBBP8Q99708 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RBBP8Q99708 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RBBP8Q99708 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RBBP8Q99708 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
RBBP8Q99708 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
RBBP8Q99708 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RBBP8Q99708 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RBBP8Q99708 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RBBP8Q99708 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RBBP8Q99708 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RBBP8Q99708 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RBBP8Q99708 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RBBP8Q99708 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RBBP8Q99708 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RBBP8Q99708 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RBBP8Q99708 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RBBP8Q99708 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RBBP8Q99708 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RBBP8Q99708 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RBBP8Q99708 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RBBP8Q99708 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RBBP8Q99708 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RBBP8Q99708 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RBBP8Q99708 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RBBP8Q99708 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RBBP8Q99708 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RBBP8Q99708 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RBBP8Q99708 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RBBP8Q99708 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RBBP8Q99708 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RBBP8Q99708 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RBBP8Q99708 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RBBP8Q99708 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RBBP8Q99708 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RBBP8Q99708 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RBBP8Q99708 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RBBP8Q99708 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RBBP8Q99708 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RBBP8Q99708 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RBBP8Q99708 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RBBP8Q99708 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RBBP8Q99708 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms