Protein–RNA interactions for Protein: Q99666

RGPD5, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 5/6, humanhuman

Predictions only

Length 1,765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD5Q99666 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
RGPD5Q99666 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
RGPD5Q99666 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
RGPD5Q99666 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
RGPD5Q99666 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.28
RGPD5Q99666 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC29.26■■■□□ 2.28
RGPD5Q99666 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
RGPD5Q99666 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC29.26■■■□□ 2.28
RGPD5Q99666 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
RGPD5Q99666 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
RGPD5Q99666 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
RGPD5Q99666 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
RGPD5Q99666 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
RGPD5Q99666 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
RGPD5Q99666 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
RGPD5Q99666 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
RGPD5Q99666 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
RGPD5Q99666 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
RGPD5Q99666 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
RGPD5Q99666 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
RGPD5Q99666 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
RGPD5Q99666 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC29.24■■■□□ 2.27
RGPD5Q99666 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
RGPD5Q99666 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
RGPD5Q99666 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
RGPD5Q99666 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
RGPD5Q99666 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
RGPD5Q99666 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
RGPD5Q99666 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
RGPD5Q99666 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
RGPD5Q99666 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
RGPD5Q99666 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
RGPD5Q99666 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
RGPD5Q99666 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
RGPD5Q99666 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
RGPD5Q99666 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
RGPD5Q99666 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
RGPD5Q99666 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
RGPD5Q99666 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
RGPD5Q99666 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
RGPD5Q99666 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
RGPD5Q99666 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
RGPD5Q99666 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
RGPD5Q99666 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
RGPD5Q99666 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
RGPD5Q99666 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
RGPD5Q99666 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
RGPD5Q99666 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
RGPD5Q99666 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
RGPD5Q99666 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
RGPD5Q99666 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
RGPD5Q99666 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
RGPD5Q99666 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
RGPD5Q99666 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
RGPD5Q99666 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC29.21■■■□□ 2.27
RGPD5Q99666 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
RGPD5Q99666 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
RGPD5Q99666 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
RGPD5Q99666 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
RGPD5Q99666 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
RGPD5Q99666 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
RGPD5Q99666 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
RGPD5Q99666 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
RGPD5Q99666 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
RGPD5Q99666 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
RGPD5Q99666 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
RGPD5Q99666 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
RGPD5Q99666 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
RGPD5Q99666 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
RGPD5Q99666 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
RGPD5Q99666 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC29.2■■■□□ 2.26
RGPD5Q99666 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
RGPD5Q99666 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
RGPD5Q99666 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
RGPD5Q99666 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
RGPD5Q99666 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
RGPD5Q99666 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC29.19■■■□□ 2.26
RGPD5Q99666 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
RGPD5Q99666 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
RGPD5Q99666 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
RGPD5Q99666 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
RGPD5Q99666 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
RGPD5Q99666 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
RGPD5Q99666 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
RGPD5Q99666 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
RGPD5Q99666 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
RGPD5Q99666 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
RGPD5Q99666 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
RGPD5Q99666 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
RGPD5Q99666 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
RGPD5Q99666 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
RGPD5Q99666 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
RGPD5Q99666 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
RGPD5Q99666 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
RGPD5Q99666 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
RGPD5Q99666 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
RGPD5Q99666 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
RGPD5Q99666 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
RGPD5Q99666 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
RGPD5Q99666 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms