Protein–RNA interactions for Protein: Q99618

CDCA3, Cell division cycle-associated protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA3Q99618 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CDCA3Q99618 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CDCA3Q99618 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDCA3Q99618 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDCA3Q99618 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDCA3Q99618 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDCA3Q99618 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDCA3Q99618 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDCA3Q99618 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDCA3Q99618 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDCA3Q99618 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDCA3Q99618 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDCA3Q99618 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CDCA3Q99618 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDCA3Q99618 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDCA3Q99618 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDCA3Q99618 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDCA3Q99618 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDCA3Q99618 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDCA3Q99618 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDCA3Q99618 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDCA3Q99618 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDCA3Q99618 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDCA3Q99618 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDCA3Q99618 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDCA3Q99618 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDCA3Q99618 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CDCA3Q99618 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CDCA3Q99618 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CDCA3Q99618 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CDCA3Q99618 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CDCA3Q99618 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CDCA3Q99618 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CDCA3Q99618 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CDCA3Q99618 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CDCA3Q99618 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CDCA3Q99618 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDCA3Q99618 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDCA3Q99618 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDCA3Q99618 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDCA3Q99618 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDCA3Q99618 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDCA3Q99618 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDCA3Q99618 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDCA3Q99618 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDCA3Q99618 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDCA3Q99618 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDCA3Q99618 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDCA3Q99618 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDCA3Q99618 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDCA3Q99618 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDCA3Q99618 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDCA3Q99618 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CDCA3Q99618 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CDCA3Q99618 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDCA3Q99618 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDCA3Q99618 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDCA3Q99618 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDCA3Q99618 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CDCA3Q99618 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDCA3Q99618 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDCA3Q99618 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDCA3Q99618 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDCA3Q99618 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDCA3Q99618 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDCA3Q99618 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CDCA3Q99618 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDCA3Q99618 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDCA3Q99618 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CDCA3Q99618 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDCA3Q99618 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDCA3Q99618 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDCA3Q99618 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDCA3Q99618 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDCA3Q99618 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDCA3Q99618 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CDCA3Q99618 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDCA3Q99618 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CDCA3Q99618 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDCA3Q99618 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDCA3Q99618 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDCA3Q99618 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CDCA3Q99618 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDCA3Q99618 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDCA3Q99618 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CDCA3Q99618 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDCA3Q99618 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDCA3Q99618 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDCA3Q99618 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CDCA3Q99618 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDCA3Q99618 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDCA3Q99618 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDCA3Q99618 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDCA3Q99618 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDCA3Q99618 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDCA3Q99618 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDCA3Q99618 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDCA3Q99618 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDCA3Q99618 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDCA3Q99618 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms