Protein–RNA interactions for Protein: Q99457

NAP1L3, Nucleosome assembly protein 1-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAP1L3Q99457 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NAP1L3Q99457 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NAP1L3Q99457 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NAP1L3Q99457 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
NAP1L3Q99457 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
NAP1L3Q99457 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NAP1L3Q99457 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NAP1L3Q99457 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NAP1L3Q99457 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NAP1L3Q99457 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NAP1L3Q99457 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NAP1L3Q99457 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NAP1L3Q99457 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NAP1L3Q99457 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NAP1L3Q99457 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NAP1L3Q99457 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NAP1L3Q99457 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NAP1L3Q99457 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NAP1L3Q99457 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NAP1L3Q99457 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NAP1L3Q99457 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NAP1L3Q99457 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NAP1L3Q99457 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NAP1L3Q99457 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NAP1L3Q99457 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NAP1L3Q99457 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
NAP1L3Q99457 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NAP1L3Q99457 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NAP1L3Q99457 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NAP1L3Q99457 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NAP1L3Q99457 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NAP1L3Q99457 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NAP1L3Q99457 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NAP1L3Q99457 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NAP1L3Q99457 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NAP1L3Q99457 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
NAP1L3Q99457 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NAP1L3Q99457 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NAP1L3Q99457 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NAP1L3Q99457 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NAP1L3Q99457 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NAP1L3Q99457 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NAP1L3Q99457 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NAP1L3Q99457 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
NAP1L3Q99457 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NAP1L3Q99457 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
NAP1L3Q99457 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NAP1L3Q99457 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NAP1L3Q99457 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NAP1L3Q99457 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NAP1L3Q99457 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NAP1L3Q99457 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NAP1L3Q99457 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NAP1L3Q99457 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NAP1L3Q99457 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NAP1L3Q99457 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
NAP1L3Q99457 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NAP1L3Q99457 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NAP1L3Q99457 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NAP1L3Q99457 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NAP1L3Q99457 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
NAP1L3Q99457 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NAP1L3Q99457 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NAP1L3Q99457 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
NAP1L3Q99457 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NAP1L3Q99457 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
NAP1L3Q99457 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NAP1L3Q99457 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NAP1L3Q99457 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NAP1L3Q99457 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NAP1L3Q99457 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NAP1L3Q99457 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NAP1L3Q99457 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NAP1L3Q99457 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NAP1L3Q99457 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
NAP1L3Q99457 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NAP1L3Q99457 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NAP1L3Q99457 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NAP1L3Q99457 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NAP1L3Q99457 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NAP1L3Q99457 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
NAP1L3Q99457 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NAP1L3Q99457 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NAP1L3Q99457 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NAP1L3Q99457 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NAP1L3Q99457 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NAP1L3Q99457 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NAP1L3Q99457 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NAP1L3Q99457 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NAP1L3Q99457 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NAP1L3Q99457 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
NAP1L3Q99457 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NAP1L3Q99457 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NAP1L3Q99457 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NAP1L3Q99457 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NAP1L3Q99457 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NAP1L3Q99457 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NAP1L3Q99457 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NAP1L3Q99457 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NAP1L3Q99457 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms