Protein–RNA interactions for Protein: Q96SJ8

TSPAN18, Tetraspanin-18, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN18Q96SJ8 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TSPAN18Q96SJ8 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TSPAN18Q96SJ8 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
TSPAN18Q96SJ8 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TSPAN18Q96SJ8 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TSPAN18Q96SJ8 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TSPAN18Q96SJ8 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TSPAN18Q96SJ8 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TSPAN18Q96SJ8 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TSPAN18Q96SJ8 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TSPAN18Q96SJ8 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TSPAN18Q96SJ8 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TSPAN18Q96SJ8 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TSPAN18Q96SJ8 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TSPAN18Q96SJ8 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TSPAN18Q96SJ8 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TSPAN18Q96SJ8 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TSPAN18Q96SJ8 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TSPAN18Q96SJ8 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TSPAN18Q96SJ8 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TSPAN18Q96SJ8 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TSPAN18Q96SJ8 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TSPAN18Q96SJ8 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TSPAN18Q96SJ8 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TSPAN18Q96SJ8 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TSPAN18Q96SJ8 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TSPAN18Q96SJ8 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TSPAN18Q96SJ8 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TSPAN18Q96SJ8 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TSPAN18Q96SJ8 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TSPAN18Q96SJ8 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TSPAN18Q96SJ8 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TSPAN18Q96SJ8 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TSPAN18Q96SJ8 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TSPAN18Q96SJ8 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TSPAN18Q96SJ8 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TSPAN18Q96SJ8 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TSPAN18Q96SJ8 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TSPAN18Q96SJ8 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TSPAN18Q96SJ8 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TSPAN18Q96SJ8 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TSPAN18Q96SJ8 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TSPAN18Q96SJ8 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TSPAN18Q96SJ8 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TSPAN18Q96SJ8 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TSPAN18Q96SJ8 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TSPAN18Q96SJ8 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TSPAN18Q96SJ8 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TSPAN18Q96SJ8 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TSPAN18Q96SJ8 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TSPAN18Q96SJ8 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TSPAN18Q96SJ8 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TSPAN18Q96SJ8 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TSPAN18Q96SJ8 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TSPAN18Q96SJ8 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TSPAN18Q96SJ8 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TSPAN18Q96SJ8 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TSPAN18Q96SJ8 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TSPAN18Q96SJ8 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TSPAN18Q96SJ8 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TSPAN18Q96SJ8 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TSPAN18Q96SJ8 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TSPAN18Q96SJ8 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TSPAN18Q96SJ8 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TSPAN18Q96SJ8 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TSPAN18Q96SJ8 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TSPAN18Q96SJ8 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TSPAN18Q96SJ8 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TSPAN18Q96SJ8 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TSPAN18Q96SJ8 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TSPAN18Q96SJ8 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TSPAN18Q96SJ8 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TSPAN18Q96SJ8 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TSPAN18Q96SJ8 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TSPAN18Q96SJ8 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TSPAN18Q96SJ8 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TSPAN18Q96SJ8 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TSPAN18Q96SJ8 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TSPAN18Q96SJ8 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TSPAN18Q96SJ8 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TSPAN18Q96SJ8 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TSPAN18Q96SJ8 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
TSPAN18Q96SJ8 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TSPAN18Q96SJ8 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TSPAN18Q96SJ8 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TSPAN18Q96SJ8 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TSPAN18Q96SJ8 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TSPAN18Q96SJ8 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
TSPAN18Q96SJ8 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TSPAN18Q96SJ8 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TSPAN18Q96SJ8 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TSPAN18Q96SJ8 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TSPAN18Q96SJ8 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TSPAN18Q96SJ8 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TSPAN18Q96SJ8 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TSPAN18Q96SJ8 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TSPAN18Q96SJ8 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TSPAN18Q96SJ8 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TSPAN18Q96SJ8 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TSPAN18Q96SJ8 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms