Protein–RNA interactions for Protein: Q96S37

SLC22A12, Solute carrier family 22 member 12, humanhuman

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC22A12Q96S37 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC22A12Q96S37 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC22A12Q96S37 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC22A12Q96S37 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC22A12Q96S37 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC22A12Q96S37 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC22A12Q96S37 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC22A12Q96S37 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC22A12Q96S37 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC22A12Q96S37 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC22A12Q96S37 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC22A12Q96S37 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC22A12Q96S37 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC22A12Q96S37 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC22A12Q96S37 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC22A12Q96S37 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC22A12Q96S37 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC22A12Q96S37 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC22A12Q96S37 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC22A12Q96S37 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC22A12Q96S37 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC22A12Q96S37 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC22A12Q96S37 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC22A12Q96S37 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC22A12Q96S37 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC22A12Q96S37 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC22A12Q96S37 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC22A12Q96S37 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC22A12Q96S37 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC22A12Q96S37 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC22A12Q96S37 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC22A12Q96S37 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC22A12Q96S37 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC22A12Q96S37 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC22A12Q96S37 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC22A12Q96S37 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC22A12Q96S37 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC22A12Q96S37 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC22A12Q96S37 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC22A12Q96S37 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC22A12Q96S37 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC22A12Q96S37 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC22A12Q96S37 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC22A12Q96S37 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC22A12Q96S37 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC22A12Q96S37 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC22A12Q96S37 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC22A12Q96S37 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC22A12Q96S37 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC22A12Q96S37 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC22A12Q96S37 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC22A12Q96S37 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC22A12Q96S37 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC22A12Q96S37 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC22A12Q96S37 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC22A12Q96S37 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC22A12Q96S37 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC22A12Q96S37 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC22A12Q96S37 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC22A12Q96S37 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC22A12Q96S37 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC22A12Q96S37 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC22A12Q96S37 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC22A12Q96S37 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC22A12Q96S37 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC22A12Q96S37 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC22A12Q96S37 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC22A12Q96S37 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC22A12Q96S37 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC22A12Q96S37 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC22A12Q96S37 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC22A12Q96S37 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC22A12Q96S37 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC22A12Q96S37 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC22A12Q96S37 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC22A12Q96S37 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC22A12Q96S37 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC22A12Q96S37 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC22A12Q96S37 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC22A12Q96S37 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC22A12Q96S37 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SLC22A12Q96S37 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC22A12Q96S37 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC22A12Q96S37 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC22A12Q96S37 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC22A12Q96S37 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC22A12Q96S37 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC22A12Q96S37 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC22A12Q96S37 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC22A12Q96S37 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC22A12Q96S37 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC22A12Q96S37 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC22A12Q96S37 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC22A12Q96S37 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC22A12Q96S37 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC22A12Q96S37 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC22A12Q96S37 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC22A12Q96S37 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC22A12Q96S37 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC22A12Q96S37 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms