Protein–RNA interactions for Protein: Q96RY5

CRAMP1, Protein cramped-like, humanhuman

Predictions only

Length 1,269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRAMP1Q96RY5 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CRAMP1Q96RY5 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CRAMP1Q96RY5 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CRAMP1Q96RY5 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CRAMP1Q96RY5 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
CRAMP1Q96RY5 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CRAMP1Q96RY5 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CRAMP1Q96RY5 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CRAMP1Q96RY5 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CRAMP1Q96RY5 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CRAMP1Q96RY5 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CRAMP1Q96RY5 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CRAMP1Q96RY5 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CRAMP1Q96RY5 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CRAMP1Q96RY5 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CRAMP1Q96RY5 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CRAMP1Q96RY5 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CRAMP1Q96RY5 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CRAMP1Q96RY5 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CRAMP1Q96RY5 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CRAMP1Q96RY5 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CRAMP1Q96RY5 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CRAMP1Q96RY5 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CRAMP1Q96RY5 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC27■■□□□ 1.91
CRAMP1Q96RY5 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
CRAMP1Q96RY5 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CRAMP1Q96RY5 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CRAMP1Q96RY5 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CRAMP1Q96RY5 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC27■■□□□ 1.91
CRAMP1Q96RY5 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
CRAMP1Q96RY5 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC27■■□□□ 1.91
CRAMP1Q96RY5 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC27■■□□□ 1.91
CRAMP1Q96RY5 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CRAMP1Q96RY5 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
CRAMP1Q96RY5 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CRAMP1Q96RY5 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CRAMP1Q96RY5 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CRAMP1Q96RY5 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
CRAMP1Q96RY5 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CRAMP1Q96RY5 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CRAMP1Q96RY5 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CRAMP1Q96RY5 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
CRAMP1Q96RY5 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
CRAMP1Q96RY5 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
CRAMP1Q96RY5 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CRAMP1Q96RY5 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CRAMP1Q96RY5 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CRAMP1Q96RY5 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CRAMP1Q96RY5 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CRAMP1Q96RY5 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CRAMP1Q96RY5 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CRAMP1Q96RY5 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CRAMP1Q96RY5 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CRAMP1Q96RY5 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CRAMP1Q96RY5 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CRAMP1Q96RY5 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CRAMP1Q96RY5 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CRAMP1Q96RY5 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CRAMP1Q96RY5 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CRAMP1Q96RY5 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CRAMP1Q96RY5 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CRAMP1Q96RY5 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
CRAMP1Q96RY5 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CRAMP1Q96RY5 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CRAMP1Q96RY5 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
CRAMP1Q96RY5 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CRAMP1Q96RY5 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CRAMP1Q96RY5 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CRAMP1Q96RY5 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
CRAMP1Q96RY5 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CRAMP1Q96RY5 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CRAMP1Q96RY5 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CRAMP1Q96RY5 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CRAMP1Q96RY5 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CRAMP1Q96RY5 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
CRAMP1Q96RY5 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CRAMP1Q96RY5 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CRAMP1Q96RY5 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CRAMP1Q96RY5 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CRAMP1Q96RY5 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CRAMP1Q96RY5 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CRAMP1Q96RY5 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CRAMP1Q96RY5 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CRAMP1Q96RY5 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CRAMP1Q96RY5 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CRAMP1Q96RY5 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CRAMP1Q96RY5 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CRAMP1Q96RY5 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CRAMP1Q96RY5 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CRAMP1Q96RY5 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CRAMP1Q96RY5 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CRAMP1Q96RY5 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CRAMP1Q96RY5 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
CRAMP1Q96RY5 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CRAMP1Q96RY5 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CRAMP1Q96RY5 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CRAMP1Q96RY5 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CRAMP1Q96RY5 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CRAMP1Q96RY5 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CRAMP1Q96RY5 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms