Protein–RNA interactions for Protein: Q96RN5

MED15, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 15, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED15Q96RN5 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MED15Q96RN5 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MED15Q96RN5 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MED15Q96RN5 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MED15Q96RN5 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MED15Q96RN5 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
MED15Q96RN5 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MED15Q96RN5 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MED15Q96RN5 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MED15Q96RN5 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MED15Q96RN5 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
MED15Q96RN5 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
MED15Q96RN5 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
MED15Q96RN5 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
MED15Q96RN5 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
MED15Q96RN5 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
MED15Q96RN5 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MED15Q96RN5 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MED15Q96RN5 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MED15Q96RN5 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MED15Q96RN5 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MED15Q96RN5 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MED15Q96RN5 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MED15Q96RN5 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MED15Q96RN5 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MED15Q96RN5 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MED15Q96RN5 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MED15Q96RN5 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MED15Q96RN5 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MED15Q96RN5 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MED15Q96RN5 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MED15Q96RN5 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MED15Q96RN5 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MED15Q96RN5 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MED15Q96RN5 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MED15Q96RN5 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MED15Q96RN5 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MED15Q96RN5 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MED15Q96RN5 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MED15Q96RN5 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MED15Q96RN5 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MED15Q96RN5 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MED15Q96RN5 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MED15Q96RN5 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MED15Q96RN5 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MED15Q96RN5 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MED15Q96RN5 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MED15Q96RN5 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MED15Q96RN5 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MED15Q96RN5 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MED15Q96RN5 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MED15Q96RN5 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MED15Q96RN5 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MED15Q96RN5 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
MED15Q96RN5 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
MED15Q96RN5 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
MED15Q96RN5 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
MED15Q96RN5 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MED15Q96RN5 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MED15Q96RN5 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MED15Q96RN5 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MED15Q96RN5 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MED15Q96RN5 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MED15Q96RN5 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MED15Q96RN5 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MED15Q96RN5 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MED15Q96RN5 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
MED15Q96RN5 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MED15Q96RN5 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MED15Q96RN5 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MED15Q96RN5 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MED15Q96RN5 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MED15Q96RN5 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MED15Q96RN5 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MED15Q96RN5 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MED15Q96RN5 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MED15Q96RN5 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MED15Q96RN5 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MED15Q96RN5 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MED15Q96RN5 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MED15Q96RN5 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MED15Q96RN5 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MED15Q96RN5 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MED15Q96RN5 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MED15Q96RN5 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MED15Q96RN5 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MED15Q96RN5 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MED15Q96RN5 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MED15Q96RN5 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MED15Q96RN5 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MED15Q96RN5 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MED15Q96RN5 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MED15Q96RN5 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MED15Q96RN5 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MED15Q96RN5 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
MED15Q96RN5 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MED15Q96RN5 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
MED15Q96RN5 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MED15Q96RN5 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MED15Q96RN5 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms