Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q11

TRNT1, CCA tRNA nucleotidyltransferase 1, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 434 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRNT1Q96Q11 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRNT1Q96Q11 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRNT1Q96Q11 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
TRNT1Q96Q11 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
TRNT1Q96Q11 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRNT1Q96Q11 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRNT1Q96Q11 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRNT1Q96Q11 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRNT1Q96Q11 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRNT1Q96Q11 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRNT1Q96Q11 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
TRNT1Q96Q11 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRNT1Q96Q11 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
TRNT1Q96Q11 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRNT1Q96Q11 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRNT1Q96Q11 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRNT1Q96Q11 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRNT1Q96Q11 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRNT1Q96Q11 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
TRNT1Q96Q11 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRNT1Q96Q11 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
TRNT1Q96Q11 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
TRNT1Q96Q11 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
TRNT1Q96Q11 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.86
TRNT1Q96Q11 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRNT1Q96Q11 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRNT1Q96Q11 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRNT1Q96Q11 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRNT1Q96Q11 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
TRNT1Q96Q11 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRNT1Q96Q11 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRNT1Q96Q11 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRNT1Q96Q11 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRNT1Q96Q11 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRNT1Q96Q11 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRNT1Q96Q11 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRNT1Q96Q11 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRNT1Q96Q11 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRNT1Q96Q11 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRNT1Q96Q11 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRNT1Q96Q11 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRNT1Q96Q11 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
TRNT1Q96Q11 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRNT1Q96Q11 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRNT1Q96Q11 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRNT1Q96Q11 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRNT1Q96Q11 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRNT1Q96Q11 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRNT1Q96Q11 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRNT1Q96Q11 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRNT1Q96Q11 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRNT1Q96Q11 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRNT1Q96Q11 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRNT1Q96Q11 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRNT1Q96Q11 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRNT1Q96Q11 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRNT1Q96Q11 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRNT1Q96Q11 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRNT1Q96Q11 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRNT1Q96Q11 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRNT1Q96Q11 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRNT1Q96Q11 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRNT1Q96Q11 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRNT1Q96Q11 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRNT1Q96Q11 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRNT1Q96Q11 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRNT1Q96Q11 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRNT1Q96Q11 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRNT1Q96Q11 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRNT1Q96Q11 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
TRNT1Q96Q11 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRNT1Q96Q11 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRNT1Q96Q11 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRNT1Q96Q11 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRNT1Q96Q11 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRNT1Q96Q11 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRNT1Q96Q11 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRNT1Q96Q11 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRNT1Q96Q11 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRNT1Q96Q11 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRNT1Q96Q11 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRNT1Q96Q11 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRNT1Q96Q11 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRNT1Q96Q11 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
TRNT1Q96Q11 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRNT1Q96Q11 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRNT1Q96Q11 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRNT1Q96Q11 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRNT1Q96Q11 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRNT1Q96Q11 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRNT1Q96Q11 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRNT1Q96Q11 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRNT1Q96Q11 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRNT1Q96Q11 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRNT1Q96Q11 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRNT1Q96Q11 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRNT1Q96Q11 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRNT1Q96Q11 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
TRNT1Q96Q11 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRNT1Q96Q11 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
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