Protein–RNA interactions for Protein: Q96NY8

NECTIN4, Nectin-4, humanhuman

Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECTIN4Q96NY8 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
NECTIN4Q96NY8 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
NECTIN4Q96NY8 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NECTIN4Q96NY8 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NECTIN4Q96NY8 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
NECTIN4Q96NY8 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NECTIN4Q96NY8 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NECTIN4Q96NY8 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NECTIN4Q96NY8 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NECTIN4Q96NY8 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NECTIN4Q96NY8 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NECTIN4Q96NY8 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NECTIN4Q96NY8 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NECTIN4Q96NY8 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NECTIN4Q96NY8 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NECTIN4Q96NY8 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NECTIN4Q96NY8 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NECTIN4Q96NY8 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NECTIN4Q96NY8 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NECTIN4Q96NY8 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NECTIN4Q96NY8 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NECTIN4Q96NY8 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
NECTIN4Q96NY8 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NECTIN4Q96NY8 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NECTIN4Q96NY8 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
NECTIN4Q96NY8 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NECTIN4Q96NY8 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NECTIN4Q96NY8 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NECTIN4Q96NY8 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NECTIN4Q96NY8 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NECTIN4Q96NY8 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NECTIN4Q96NY8 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NECTIN4Q96NY8 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NECTIN4Q96NY8 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NECTIN4Q96NY8 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NECTIN4Q96NY8 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NECTIN4Q96NY8 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NECTIN4Q96NY8 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NECTIN4Q96NY8 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NECTIN4Q96NY8 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NECTIN4Q96NY8 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NECTIN4Q96NY8 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NECTIN4Q96NY8 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NECTIN4Q96NY8 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NECTIN4Q96NY8 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NECTIN4Q96NY8 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NECTIN4Q96NY8 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NECTIN4Q96NY8 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NECTIN4Q96NY8 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NECTIN4Q96NY8 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NECTIN4Q96NY8 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
NECTIN4Q96NY8 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NECTIN4Q96NY8 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NECTIN4Q96NY8 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
NECTIN4Q96NY8 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NECTIN4Q96NY8 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NECTIN4Q96NY8 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NECTIN4Q96NY8 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NECTIN4Q96NY8 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NECTIN4Q96NY8 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NECTIN4Q96NY8 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
NECTIN4Q96NY8 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
NECTIN4Q96NY8 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NECTIN4Q96NY8 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NECTIN4Q96NY8 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NECTIN4Q96NY8 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NECTIN4Q96NY8 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NECTIN4Q96NY8 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NECTIN4Q96NY8 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NECTIN4Q96NY8 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NECTIN4Q96NY8 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NECTIN4Q96NY8 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NECTIN4Q96NY8 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NECTIN4Q96NY8 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
NECTIN4Q96NY8 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NECTIN4Q96NY8 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NECTIN4Q96NY8 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NECTIN4Q96NY8 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
NECTIN4Q96NY8 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NECTIN4Q96NY8 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NECTIN4Q96NY8 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NECTIN4Q96NY8 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NECTIN4Q96NY8 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NECTIN4Q96NY8 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NECTIN4Q96NY8 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NECTIN4Q96NY8 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NECTIN4Q96NY8 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NECTIN4Q96NY8 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
NECTIN4Q96NY8 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NECTIN4Q96NY8 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NECTIN4Q96NY8 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NECTIN4Q96NY8 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NECTIN4Q96NY8 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NECTIN4Q96NY8 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NECTIN4Q96NY8 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NECTIN4Q96NY8 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NECTIN4Q96NY8 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NECTIN4Q96NY8 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NECTIN4Q96NY8 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NECTIN4Q96NY8 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms