Protein–RNA interactions for Protein: Q96NL0

RUNDC3B, RUN domain-containing protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNDC3BQ96NL0 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RUNDC3BQ96NL0 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RUNDC3BQ96NL0 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RUNDC3BQ96NL0 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RUNDC3BQ96NL0 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
RUNDC3BQ96NL0 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RUNDC3BQ96NL0 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RUNDC3BQ96NL0 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RUNDC3BQ96NL0 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RUNDC3BQ96NL0 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RUNDC3BQ96NL0 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
RUNDC3BQ96NL0 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RUNDC3BQ96NL0 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RUNDC3BQ96NL0 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RUNDC3BQ96NL0 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RUNDC3BQ96NL0 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RUNDC3BQ96NL0 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RUNDC3BQ96NL0 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RUNDC3BQ96NL0 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RUNDC3BQ96NL0 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RUNDC3BQ96NL0 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RUNDC3BQ96NL0 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RUNDC3BQ96NL0 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RUNDC3BQ96NL0 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RUNDC3BQ96NL0 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RUNDC3BQ96NL0 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RUNDC3BQ96NL0 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RUNDC3BQ96NL0 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RUNDC3BQ96NL0 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RUNDC3BQ96NL0 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RUNDC3BQ96NL0 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RUNDC3BQ96NL0 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RUNDC3BQ96NL0 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RUNDC3BQ96NL0 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RUNDC3BQ96NL0 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RUNDC3BQ96NL0 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RUNDC3BQ96NL0 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RUNDC3BQ96NL0 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RUNDC3BQ96NL0 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
RUNDC3BQ96NL0 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RUNDC3BQ96NL0 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RUNDC3BQ96NL0 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RUNDC3BQ96NL0 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RUNDC3BQ96NL0 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RUNDC3BQ96NL0 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RUNDC3BQ96NL0 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RUNDC3BQ96NL0 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RUNDC3BQ96NL0 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RUNDC3BQ96NL0 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RUNDC3BQ96NL0 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
RUNDC3BQ96NL0 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RUNDC3BQ96NL0 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RUNDC3BQ96NL0 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RUNDC3BQ96NL0 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RUNDC3BQ96NL0 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RUNDC3BQ96NL0 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RUNDC3BQ96NL0 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RUNDC3BQ96NL0 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RUNDC3BQ96NL0 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RUNDC3BQ96NL0 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RUNDC3BQ96NL0 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RUNDC3BQ96NL0 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RUNDC3BQ96NL0 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RUNDC3BQ96NL0 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RUNDC3BQ96NL0 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RUNDC3BQ96NL0 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RUNDC3BQ96NL0 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RUNDC3BQ96NL0 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RUNDC3BQ96NL0 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RUNDC3BQ96NL0 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RUNDC3BQ96NL0 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RUNDC3BQ96NL0 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RUNDC3BQ96NL0 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RUNDC3BQ96NL0 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RUNDC3BQ96NL0 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RUNDC3BQ96NL0 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RUNDC3BQ96NL0 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RUNDC3BQ96NL0 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RUNDC3BQ96NL0 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RUNDC3BQ96NL0 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
RUNDC3BQ96NL0 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RUNDC3BQ96NL0 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RUNDC3BQ96NL0 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RUNDC3BQ96NL0 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RUNDC3BQ96NL0 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RUNDC3BQ96NL0 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RUNDC3BQ96NL0 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RUNDC3BQ96NL0 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RUNDC3BQ96NL0 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RUNDC3BQ96NL0 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RUNDC3BQ96NL0 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RUNDC3BQ96NL0 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RUNDC3BQ96NL0 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RUNDC3BQ96NL0 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RUNDC3BQ96NL0 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RUNDC3BQ96NL0 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RUNDC3BQ96NL0 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RUNDC3BQ96NL0 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RUNDC3BQ96NL0 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RUNDC3BQ96NL0 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms