Protein–RNA interactions for Protein: Q96NA8

TSNARE1, t-SNARE domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1Q96NA8 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
TSNARE1Q96NA8 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TSNARE1Q96NA8 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TSNARE1Q96NA8 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TSNARE1Q96NA8 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TSNARE1Q96NA8 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TSNARE1Q96NA8 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TSNARE1Q96NA8 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TSNARE1Q96NA8 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TSNARE1Q96NA8 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TSNARE1Q96NA8 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TSNARE1Q96NA8 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
TSNARE1Q96NA8 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TSNARE1Q96NA8 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
TSNARE1Q96NA8 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TSNARE1Q96NA8 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TSNARE1Q96NA8 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TSNARE1Q96NA8 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TSNARE1Q96NA8 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TSNARE1Q96NA8 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TSNARE1Q96NA8 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TSNARE1Q96NA8 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TSNARE1Q96NA8 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TSNARE1Q96NA8 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TSNARE1Q96NA8 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TSNARE1Q96NA8 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TSNARE1Q96NA8 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TSNARE1Q96NA8 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TSNARE1Q96NA8 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TSNARE1Q96NA8 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TSNARE1Q96NA8 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TSNARE1Q96NA8 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TSNARE1Q96NA8 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TSNARE1Q96NA8 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TSNARE1Q96NA8 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TSNARE1Q96NA8 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TSNARE1Q96NA8 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TSNARE1Q96NA8 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TSNARE1Q96NA8 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TSNARE1Q96NA8 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TSNARE1Q96NA8 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TSNARE1Q96NA8 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
TSNARE1Q96NA8 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TSNARE1Q96NA8 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
TSNARE1Q96NA8 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TSNARE1Q96NA8 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TSNARE1Q96NA8 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
TSNARE1Q96NA8 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TSNARE1Q96NA8 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
TSNARE1Q96NA8 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TSNARE1Q96NA8 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TSNARE1Q96NA8 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TSNARE1Q96NA8 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TSNARE1Q96NA8 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TSNARE1Q96NA8 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TSNARE1Q96NA8 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TSNARE1Q96NA8 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TSNARE1Q96NA8 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TSNARE1Q96NA8 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TSNARE1Q96NA8 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TSNARE1Q96NA8 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TSNARE1Q96NA8 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TSNARE1Q96NA8 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TSNARE1Q96NA8 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TSNARE1Q96NA8 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TSNARE1Q96NA8 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TSNARE1Q96NA8 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TSNARE1Q96NA8 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TSNARE1Q96NA8 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TSNARE1Q96NA8 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TSNARE1Q96NA8 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TSNARE1Q96NA8 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TSNARE1Q96NA8 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TSNARE1Q96NA8 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TSNARE1Q96NA8 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TSNARE1Q96NA8 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TSNARE1Q96NA8 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TSNARE1Q96NA8 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TSNARE1Q96NA8 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TSNARE1Q96NA8 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TSNARE1Q96NA8 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TSNARE1Q96NA8 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TSNARE1Q96NA8 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TSNARE1Q96NA8 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TSNARE1Q96NA8 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TSNARE1Q96NA8 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TSNARE1Q96NA8 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TSNARE1Q96NA8 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TSNARE1Q96NA8 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TSNARE1Q96NA8 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TSNARE1Q96NA8 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TSNARE1Q96NA8 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TSNARE1Q96NA8 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TSNARE1Q96NA8 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TSNARE1Q96NA8 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TSNARE1Q96NA8 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TSNARE1Q96NA8 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TSNARE1Q96NA8 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TSNARE1Q96NA8 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TSNARE1Q96NA8 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1086.3 ms