Protein–RNA interactions for Protein: Q96MN9

ZNF488, Zinc finger protein 488, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF488Q96MN9 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZNF488Q96MN9 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZNF488Q96MN9 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZNF488Q96MN9 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZNF488Q96MN9 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZNF488Q96MN9 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZNF488Q96MN9 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZNF488Q96MN9 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZNF488Q96MN9 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZNF488Q96MN9 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZNF488Q96MN9 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZNF488Q96MN9 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZNF488Q96MN9 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZNF488Q96MN9 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZNF488Q96MN9 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZNF488Q96MN9 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZNF488Q96MN9 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZNF488Q96MN9 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
ZNF488Q96MN9 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZNF488Q96MN9 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZNF488Q96MN9 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZNF488Q96MN9 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZNF488Q96MN9 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZNF488Q96MN9 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZNF488Q96MN9 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZNF488Q96MN9 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZNF488Q96MN9 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZNF488Q96MN9 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZNF488Q96MN9 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZNF488Q96MN9 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZNF488Q96MN9 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNF488Q96MN9 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNF488Q96MN9 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNF488Q96MN9 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNF488Q96MN9 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNF488Q96MN9 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNF488Q96MN9 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNF488Q96MN9 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNF488Q96MN9 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNF488Q96MN9 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNF488Q96MN9 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNF488Q96MN9 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNF488Q96MN9 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNF488Q96MN9 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNF488Q96MN9 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ZNF488Q96MN9 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ZNF488Q96MN9 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ZNF488Q96MN9 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF488Q96MN9 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF488Q96MN9 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF488Q96MN9 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF488Q96MN9 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF488Q96MN9 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF488Q96MN9 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF488Q96MN9 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF488Q96MN9 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF488Q96MN9 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF488Q96MN9 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF488Q96MN9 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF488Q96MN9 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF488Q96MN9 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF488Q96MN9 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF488Q96MN9 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF488Q96MN9 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF488Q96MN9 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF488Q96MN9 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF488Q96MN9 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF488Q96MN9 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF488Q96MN9 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF488Q96MN9 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF488Q96MN9 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF488Q96MN9 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF488Q96MN9 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF488Q96MN9 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF488Q96MN9 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF488Q96MN9 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF488Q96MN9 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF488Q96MN9 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF488Q96MN9 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF488Q96MN9 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF488Q96MN9 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF488Q96MN9 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF488Q96MN9 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF488Q96MN9 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF488Q96MN9 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF488Q96MN9 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF488Q96MN9 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF488Q96MN9 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF488Q96MN9 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF488Q96MN9 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF488Q96MN9 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF488Q96MN9 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF488Q96MN9 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF488Q96MN9 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF488Q96MN9 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF488Q96MN9 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF488Q96MN9 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF488Q96MN9 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF488Q96MN9 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF488Q96MN9 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms