Protein–RNA interactions for Protein: Q96LX7

CCDC17, Coiled-coil domain-containing protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC17Q96LX7 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC17Q96LX7 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC17Q96LX7 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC17Q96LX7 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC17Q96LX7 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC17Q96LX7 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC17Q96LX7 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC17Q96LX7 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC17Q96LX7 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC17Q96LX7 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC17Q96LX7 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC17Q96LX7 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC17Q96LX7 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC17Q96LX7 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC17Q96LX7 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC17Q96LX7 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC17Q96LX7 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC17Q96LX7 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC17Q96LX7 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC17Q96LX7 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC17Q96LX7 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC17Q96LX7 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC17Q96LX7 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC17Q96LX7 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC17Q96LX7 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC17Q96LX7 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC17Q96LX7 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC17Q96LX7 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC17Q96LX7 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC17Q96LX7 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC17Q96LX7 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC17Q96LX7 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC17Q96LX7 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC17Q96LX7 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC17Q96LX7 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC17Q96LX7 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC17Q96LX7 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC17Q96LX7 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC17Q96LX7 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC17Q96LX7 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC17Q96LX7 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC17Q96LX7 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC17Q96LX7 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC17Q96LX7 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC17Q96LX7 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC17Q96LX7 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC17Q96LX7 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC17Q96LX7 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC17Q96LX7 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC17Q96LX7 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC17Q96LX7 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC17Q96LX7 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
CCDC17Q96LX7 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC17Q96LX7 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC17Q96LX7 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC17Q96LX7 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC17Q96LX7 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC17Q96LX7 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC17Q96LX7 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC17Q96LX7 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC17Q96LX7 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC17Q96LX7 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC17Q96LX7 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC17Q96LX7 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC17Q96LX7 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC17Q96LX7 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC17Q96LX7 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC17Q96LX7 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC17Q96LX7 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC17Q96LX7 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC17Q96LX7 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC17Q96LX7 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC17Q96LX7 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC17Q96LX7 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC17Q96LX7 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC17Q96LX7 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC17Q96LX7 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC17Q96LX7 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC17Q96LX7 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC17Q96LX7 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC17Q96LX7 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC17Q96LX7 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC17Q96LX7 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC17Q96LX7 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC17Q96LX7 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC17Q96LX7 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC17Q96LX7 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC17Q96LX7 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC17Q96LX7 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC17Q96LX7 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC17Q96LX7 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC17Q96LX7 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC17Q96LX7 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC17Q96LX7 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC17Q96LX7 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC17Q96LX7 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC17Q96LX7 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC17Q96LX7 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC17Q96LX7 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC17Q96LX7 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms