Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD8

SENP8, Sentrin-specific protease 8, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP8Q96LD8 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SENP8Q96LD8 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SENP8Q96LD8 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SENP8Q96LD8 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SENP8Q96LD8 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SENP8Q96LD8 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SENP8Q96LD8 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SENP8Q96LD8 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SENP8Q96LD8 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SENP8Q96LD8 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SENP8Q96LD8 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SENP8Q96LD8 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SENP8Q96LD8 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SENP8Q96LD8 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SENP8Q96LD8 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SENP8Q96LD8 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SENP8Q96LD8 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SENP8Q96LD8 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SENP8Q96LD8 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SENP8Q96LD8 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SENP8Q96LD8 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SENP8Q96LD8 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SENP8Q96LD8 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SENP8Q96LD8 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SENP8Q96LD8 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SENP8Q96LD8 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SENP8Q96LD8 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SENP8Q96LD8 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SENP8Q96LD8 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SENP8Q96LD8 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SENP8Q96LD8 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SENP8Q96LD8 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SENP8Q96LD8 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SENP8Q96LD8 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SENP8Q96LD8 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SENP8Q96LD8 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SENP8Q96LD8 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SENP8Q96LD8 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SENP8Q96LD8 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SENP8Q96LD8 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SENP8Q96LD8 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SENP8Q96LD8 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SENP8Q96LD8 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SENP8Q96LD8 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SENP8Q96LD8 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SENP8Q96LD8 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SENP8Q96LD8 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SENP8Q96LD8 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SENP8Q96LD8 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SENP8Q96LD8 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SENP8Q96LD8 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SENP8Q96LD8 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SENP8Q96LD8 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SENP8Q96LD8 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SENP8Q96LD8 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SENP8Q96LD8 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SENP8Q96LD8 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SENP8Q96LD8 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SENP8Q96LD8 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SENP8Q96LD8 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SENP8Q96LD8 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SENP8Q96LD8 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SENP8Q96LD8 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SENP8Q96LD8 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
SENP8Q96LD8 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SENP8Q96LD8 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SENP8Q96LD8 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SENP8Q96LD8 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SENP8Q96LD8 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SENP8Q96LD8 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SENP8Q96LD8 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SENP8Q96LD8 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SENP8Q96LD8 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SENP8Q96LD8 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SENP8Q96LD8 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SENP8Q96LD8 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SENP8Q96LD8 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SENP8Q96LD8 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SENP8Q96LD8 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SENP8Q96LD8 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SENP8Q96LD8 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SENP8Q96LD8 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SENP8Q96LD8 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SENP8Q96LD8 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SENP8Q96LD8 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SENP8Q96LD8 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SENP8Q96LD8 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SENP8Q96LD8 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SENP8Q96LD8 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SENP8Q96LD8 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SENP8Q96LD8 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SENP8Q96LD8 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SENP8Q96LD8 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SENP8Q96LD8 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SENP8Q96LD8 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SENP8Q96LD8 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SENP8Q96LD8 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SENP8Q96LD8 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SENP8Q96LD8 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SENP8Q96LD8 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms