Protein–RNA interactions for Protein: Q96L42

KCNH8, Potassium voltage-gated channel subfamily H member 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNH8Q96L42 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
KCNH8Q96L42 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
KCNH8Q96L42 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
KCNH8Q96L42 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
KCNH8Q96L42 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
KCNH8Q96L42 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
KCNH8Q96L42 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
KCNH8Q96L42 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC34.22■■■■□ 3.07
KCNH8Q96L42 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC34.22■■■■□ 3.07
KCNH8Q96L42 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
KCNH8Q96L42 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
KCNH8Q96L42 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
KCNH8Q96L42 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
KCNH8Q96L42 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
KCNH8Q96L42 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
KCNH8Q96L42 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
KCNH8Q96L42 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
KCNH8Q96L42 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC34.21■■■■□ 3.07
KCNH8Q96L42 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
KCNH8Q96L42 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC34.21■■■■□ 3.07
KCNH8Q96L42 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
KCNH8Q96L42 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
KCNH8Q96L42 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.07
KCNH8Q96L42 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.07
KCNH8Q96L42 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
KCNH8Q96L42 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.06
KCNH8Q96L42 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
KCNH8Q96L42 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
KCNH8Q96L42 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
KCNH8Q96L42 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC34.19■■■■□ 3.06
KCNH8Q96L42 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC34.19■■■■□ 3.06
KCNH8Q96L42 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
KCNH8Q96L42 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC34.19■■■■□ 3.06
KCNH8Q96L42 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
KCNH8Q96L42 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
KCNH8Q96L42 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC34.19■■■■□ 3.06
KCNH8Q96L42 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
KCNH8Q96L42 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
KCNH8Q96L42 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
KCNH8Q96L42 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
KCNH8Q96L42 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC34.18■■■■□ 3.06
KCNH8Q96L42 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC34.18■■■■□ 3.06
KCNH8Q96L42 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
KCNH8Q96L42 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
KCNH8Q96L42 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
KCNH8Q96L42 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
KCNH8Q96L42 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC34.17■■■■□ 3.06
KCNH8Q96L42 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
KCNH8Q96L42 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
KCNH8Q96L42 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC34.17■■■■□ 3.06
KCNH8Q96L42 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
KCNH8Q96L42 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC34.17■■■■□ 3.06
KCNH8Q96L42 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
KCNH8Q96L42 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC34.17■■■■□ 3.06
KCNH8Q96L42 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC34.17■■■■□ 3.06
KCNH8Q96L42 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC34.17■■■■□ 3.06
KCNH8Q96L42 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
KCNH8Q96L42 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC34.16■■■■□ 3.06
KCNH8Q96L42 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
KCNH8Q96L42 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
KCNH8Q96L42 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
KCNH8Q96L42 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
KCNH8Q96L42 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
KCNH8Q96L42 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
KCNH8Q96L42 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
KCNH8Q96L42 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
KCNH8Q96L42 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
KCNH8Q96L42 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
KCNH8Q96L42 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
KCNH8Q96L42 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
KCNH8Q96L42 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
KCNH8Q96L42 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
KCNH8Q96L42 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
KCNH8Q96L42 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
KCNH8Q96L42 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
KCNH8Q96L42 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
KCNH8Q96L42 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
KCNH8Q96L42 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
KCNH8Q96L42 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC34.12■■■■□ 3.05
KCNH8Q96L42 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
KCNH8Q96L42 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
KCNH8Q96L42 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
KCNH8Q96L42 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
KCNH8Q96L42 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
KCNH8Q96L42 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
KCNH8Q96L42 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC34.11■■■■□ 3.05
KCNH8Q96L42 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
KCNH8Q96L42 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
KCNH8Q96L42 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
KCNH8Q96L42 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
KCNH8Q96L42 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
KCNH8Q96L42 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC34.1■■■■□ 3.05
KCNH8Q96L42 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
KCNH8Q96L42 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC34.1■■■■□ 3.05
KCNH8Q96L42 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
KCNH8Q96L42 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC34.09■■■■□ 3.05
KCNH8Q96L42 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
KCNH8Q96L42 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
KCNH8Q96L42 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
KCNH8Q96L42 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms