Protein–RNA interactions for Protein: Q96K49

TMEM87B, Transmembrane protein 87B, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM87BQ96K49 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
TMEM87BQ96K49 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
TMEM87BQ96K49 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TMEM87BQ96K49 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TMEM87BQ96K49 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TMEM87BQ96K49 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TMEM87BQ96K49 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TMEM87BQ96K49 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TMEM87BQ96K49 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TMEM87BQ96K49 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TMEM87BQ96K49 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TMEM87BQ96K49 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TMEM87BQ96K49 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TMEM87BQ96K49 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TMEM87BQ96K49 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TMEM87BQ96K49 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TMEM87BQ96K49 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
TMEM87BQ96K49 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TMEM87BQ96K49 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TMEM87BQ96K49 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
TMEM87BQ96K49 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TMEM87BQ96K49 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TMEM87BQ96K49 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TMEM87BQ96K49 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TMEM87BQ96K49 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
TMEM87BQ96K49 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
TMEM87BQ96K49 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TMEM87BQ96K49 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TMEM87BQ96K49 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
TMEM87BQ96K49 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TMEM87BQ96K49 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
TMEM87BQ96K49 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TMEM87BQ96K49 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TMEM87BQ96K49 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TMEM87BQ96K49 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TMEM87BQ96K49 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TMEM87BQ96K49 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TMEM87BQ96K49 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
TMEM87BQ96K49 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
TMEM87BQ96K49 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TMEM87BQ96K49 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TMEM87BQ96K49 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TMEM87BQ96K49 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TMEM87BQ96K49 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TMEM87BQ96K49 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TMEM87BQ96K49 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TMEM87BQ96K49 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
TMEM87BQ96K49 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TMEM87BQ96K49 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TMEM87BQ96K49 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
TMEM87BQ96K49 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TMEM87BQ96K49 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TMEM87BQ96K49 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TMEM87BQ96K49 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TMEM87BQ96K49 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TMEM87BQ96K49 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TMEM87BQ96K49 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
TMEM87BQ96K49 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TMEM87BQ96K49 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TMEM87BQ96K49 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TMEM87BQ96K49 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TMEM87BQ96K49 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TMEM87BQ96K49 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TMEM87BQ96K49 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TMEM87BQ96K49 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TMEM87BQ96K49 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
TMEM87BQ96K49 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TMEM87BQ96K49 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TMEM87BQ96K49 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
TMEM87BQ96K49 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TMEM87BQ96K49 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TMEM87BQ96K49 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TMEM87BQ96K49 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TMEM87BQ96K49 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TMEM87BQ96K49 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TMEM87BQ96K49 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TMEM87BQ96K49 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TMEM87BQ96K49 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
TMEM87BQ96K49 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TMEM87BQ96K49 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TMEM87BQ96K49 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TMEM87BQ96K49 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TMEM87BQ96K49 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TMEM87BQ96K49 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TMEM87BQ96K49 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TMEM87BQ96K49 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TMEM87BQ96K49 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TMEM87BQ96K49 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TMEM87BQ96K49 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TMEM87BQ96K49 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TMEM87BQ96K49 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TMEM87BQ96K49 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TMEM87BQ96K49 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
TMEM87BQ96K49 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TMEM87BQ96K49 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TMEM87BQ96K49 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TMEM87BQ96K49 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TMEM87BQ96K49 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TMEM87BQ96K49 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TMEM87BQ96K49 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms