Protein–RNA interactions for Protein: Q96IU2

ZBED3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED3Q96IU2 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ZBED3Q96IU2 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
ZBED3Q96IU2 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ZBED3Q96IU2 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ZBED3Q96IU2 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ZBED3Q96IU2 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ZBED3Q96IU2 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ZBED3Q96IU2 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ZBED3Q96IU2 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ZBED3Q96IU2 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ZBED3Q96IU2 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ZBED3Q96IU2 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ZBED3Q96IU2 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ZBED3Q96IU2 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ZBED3Q96IU2 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ZBED3Q96IU2 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ZBED3Q96IU2 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
ZBED3Q96IU2 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ZBED3Q96IU2 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
ZBED3Q96IU2 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ZBED3Q96IU2 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ZBED3Q96IU2 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
ZBED3Q96IU2 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ZBED3Q96IU2 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ZBED3Q96IU2 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ZBED3Q96IU2 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ZBED3Q96IU2 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ZBED3Q96IU2 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ZBED3Q96IU2 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
ZBED3Q96IU2 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ZBED3Q96IU2 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
ZBED3Q96IU2 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ZBED3Q96IU2 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ZBED3Q96IU2 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ZBED3Q96IU2 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ZBED3Q96IU2 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ZBED3Q96IU2 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ZBED3Q96IU2 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ZBED3Q96IU2 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ZBED3Q96IU2 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
ZBED3Q96IU2 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ZBED3Q96IU2 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ZBED3Q96IU2 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ZBED3Q96IU2 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ZBED3Q96IU2 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ZBED3Q96IU2 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ZBED3Q96IU2 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ZBED3Q96IU2 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ZBED3Q96IU2 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ZBED3Q96IU2 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ZBED3Q96IU2 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ZBED3Q96IU2 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ZBED3Q96IU2 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
ZBED3Q96IU2 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ZBED3Q96IU2 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ZBED3Q96IU2 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ZBED3Q96IU2 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
ZBED3Q96IU2 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ZBED3Q96IU2 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ZBED3Q96IU2 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ZBED3Q96IU2 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ZBED3Q96IU2 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ZBED3Q96IU2 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ZBED3Q96IU2 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ZBED3Q96IU2 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ZBED3Q96IU2 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
ZBED3Q96IU2 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ZBED3Q96IU2 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ZBED3Q96IU2 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
ZBED3Q96IU2 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ZBED3Q96IU2 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
ZBED3Q96IU2 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ZBED3Q96IU2 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
ZBED3Q96IU2 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ZBED3Q96IU2 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ZBED3Q96IU2 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
ZBED3Q96IU2 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ZBED3Q96IU2 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ZBED3Q96IU2 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
ZBED3Q96IU2 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ZBED3Q96IU2 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ZBED3Q96IU2 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
ZBED3Q96IU2 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ZBED3Q96IU2 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ZBED3Q96IU2 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ZBED3Q96IU2 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ZBED3Q96IU2 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ZBED3Q96IU2 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ZBED3Q96IU2 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ZBED3Q96IU2 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ZBED3Q96IU2 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ZBED3Q96IU2 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ZBED3Q96IU2 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ZBED3Q96IU2 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ZBED3Q96IU2 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
ZBED3Q96IU2 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ZBED3Q96IU2 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ZBED3Q96IU2 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ZBED3Q96IU2 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ZBED3Q96IU2 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
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