Protein–RNA interactions for Protein: Q96I25

RBM17, Splicing factor 45, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 401 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM17Q96I25 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RBM17Q96I25 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RBM17Q96I25 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RBM17Q96I25 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RBM17Q96I25 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RBM17Q96I25 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RBM17Q96I25 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
RBM17Q96I25 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RBM17Q96I25 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RBM17Q96I25 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
RBM17Q96I25 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RBM17Q96I25 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
RBM17Q96I25 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RBM17Q96I25 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RBM17Q96I25 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RBM17Q96I25 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RBM17Q96I25 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RBM17Q96I25 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RBM17Q96I25 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RBM17Q96I25 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RBM17Q96I25 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RBM17Q96I25 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RBM17Q96I25 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RBM17Q96I25 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RBM17Q96I25 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RBM17Q96I25 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RBM17Q96I25 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RBM17Q96I25 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RBM17Q96I25 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RBM17Q96I25 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RBM17Q96I25 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RBM17Q96I25 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RBM17Q96I25 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
RBM17Q96I25 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RBM17Q96I25 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
RBM17Q96I25 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RBM17Q96I25 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
RBM17Q96I25 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RBM17Q96I25 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RBM17Q96I25 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RBM17Q96I25 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RBM17Q96I25 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RBM17Q96I25 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RBM17Q96I25 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RBM17Q96I25 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
RBM17Q96I25 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RBM17Q96I25 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
RBM17Q96I25 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
RBM17Q96I25 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RBM17Q96I25 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
RBM17Q96I25 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RBM17Q96I25 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RBM17Q96I25 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RBM17Q96I25 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RBM17Q96I25 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RBM17Q96I25 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RBM17Q96I25 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RBM17Q96I25 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RBM17Q96I25 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RBM17Q96I25 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RBM17Q96I25 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RBM17Q96I25 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RBM17Q96I25 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RBM17Q96I25 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RBM17Q96I25 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
RBM17Q96I25 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RBM17Q96I25 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RBM17Q96I25 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RBM17Q96I25 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
RBM17Q96I25 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
RBM17Q96I25 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
RBM17Q96I25 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
RBM17Q96I25 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RBM17Q96I25 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
RBM17Q96I25 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RBM17Q96I25 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
RBM17Q96I25 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RBM17Q96I25 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RBM17Q96I25 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RBM17Q96I25 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RBM17Q96I25 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RBM17Q96I25 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RBM17Q96I25 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RBM17Q96I25 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RBM17Q96I25 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RBM17Q96I25 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RBM17Q96I25 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RBM17Q96I25 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RBM17Q96I25 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RBM17Q96I25 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RBM17Q96I25 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RBM17Q96I25 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RBM17Q96I25 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RBM17Q96I25 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RBM17Q96I25 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RBM17Q96I25 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RBM17Q96I25 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RBM17Q96I25 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RBM17Q96I25 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RBM17Q96I25 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms