Protein–RNA interactions for Protein: Q96H12

MSANTD3, Myb/SANT-like DNA-binding domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSANTD3Q96H12 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MSANTD3Q96H12 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MSANTD3Q96H12 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MSANTD3Q96H12 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MSANTD3Q96H12 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MSANTD3Q96H12 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MSANTD3Q96H12 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MSANTD3Q96H12 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MSANTD3Q96H12 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MSANTD3Q96H12 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MSANTD3Q96H12 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MSANTD3Q96H12 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MSANTD3Q96H12 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MSANTD3Q96H12 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MSANTD3Q96H12 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MSANTD3Q96H12 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MSANTD3Q96H12 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
MSANTD3Q96H12 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
MSANTD3Q96H12 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MSANTD3Q96H12 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
MSANTD3Q96H12 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MSANTD3Q96H12 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MSANTD3Q96H12 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MSANTD3Q96H12 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
MSANTD3Q96H12 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MSANTD3Q96H12 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MSANTD3Q96H12 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MSANTD3Q96H12 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MSANTD3Q96H12 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MSANTD3Q96H12 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MSANTD3Q96H12 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
MSANTD3Q96H12 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MSANTD3Q96H12 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MSANTD3Q96H12 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MSANTD3Q96H12 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MSANTD3Q96H12 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MSANTD3Q96H12 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MSANTD3Q96H12 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MSANTD3Q96H12 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MSANTD3Q96H12 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MSANTD3Q96H12 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MSANTD3Q96H12 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MSANTD3Q96H12 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MSANTD3Q96H12 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MSANTD3Q96H12 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MSANTD3Q96H12 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MSANTD3Q96H12 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MSANTD3Q96H12 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MSANTD3Q96H12 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MSANTD3Q96H12 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MSANTD3Q96H12 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MSANTD3Q96H12 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MSANTD3Q96H12 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MSANTD3Q96H12 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MSANTD3Q96H12 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MSANTD3Q96H12 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MSANTD3Q96H12 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MSANTD3Q96H12 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MSANTD3Q96H12 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
MSANTD3Q96H12 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MSANTD3Q96H12 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MSANTD3Q96H12 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MSANTD3Q96H12 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MSANTD3Q96H12 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MSANTD3Q96H12 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MSANTD3Q96H12 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MSANTD3Q96H12 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
MSANTD3Q96H12 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MSANTD3Q96H12 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MSANTD3Q96H12 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MSANTD3Q96H12 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MSANTD3Q96H12 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MSANTD3Q96H12 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MSANTD3Q96H12 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MSANTD3Q96H12 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MSANTD3Q96H12 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MSANTD3Q96H12 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
MSANTD3Q96H12 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MSANTD3Q96H12 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MSANTD3Q96H12 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MSANTD3Q96H12 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MSANTD3Q96H12 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MSANTD3Q96H12 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MSANTD3Q96H12 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
MSANTD3Q96H12 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MSANTD3Q96H12 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MSANTD3Q96H12 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
MSANTD3Q96H12 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MSANTD3Q96H12 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MSANTD3Q96H12 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MSANTD3Q96H12 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MSANTD3Q96H12 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MSANTD3Q96H12 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MSANTD3Q96H12 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MSANTD3Q96H12 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MSANTD3Q96H12 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MSANTD3Q96H12 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MSANTD3Q96H12 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MSANTD3Q96H12 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MSANTD3Q96H12 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.7 ms