Protein–RNA interactions for Protein: Q96GX9

APIP, Methylthioribulose-1-phosphate dehydratase, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APIPQ96GX9 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
APIPQ96GX9 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
APIPQ96GX9 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
APIPQ96GX9 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
APIPQ96GX9 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
APIPQ96GX9 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
APIPQ96GX9 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
APIPQ96GX9 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
APIPQ96GX9 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
APIPQ96GX9 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
APIPQ96GX9 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
APIPQ96GX9 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
APIPQ96GX9 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
APIPQ96GX9 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
APIPQ96GX9 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC20.92■□□□□ 0.94
APIPQ96GX9 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
APIPQ96GX9 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
APIPQ96GX9 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
APIPQ96GX9 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
APIPQ96GX9 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
APIPQ96GX9 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
APIPQ96GX9 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
APIPQ96GX9 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
APIPQ96GX9 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
APIPQ96GX9 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
APIPQ96GX9 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
APIPQ96GX9 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
APIPQ96GX9 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
APIPQ96GX9 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
APIPQ96GX9 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
APIPQ96GX9 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
APIPQ96GX9 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
APIPQ96GX9 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
APIPQ96GX9 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
APIPQ96GX9 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
APIPQ96GX9 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
APIPQ96GX9 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
APIPQ96GX9 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
APIPQ96GX9 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
APIPQ96GX9 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
APIPQ96GX9 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
APIPQ96GX9 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
APIPQ96GX9 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
APIPQ96GX9 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
APIPQ96GX9 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
APIPQ96GX9 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
APIPQ96GX9 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
APIPQ96GX9 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
APIPQ96GX9 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
APIPQ96GX9 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
APIPQ96GX9 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
APIPQ96GX9 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
APIPQ96GX9 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
APIPQ96GX9 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
APIPQ96GX9 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
APIPQ96GX9 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
APIPQ96GX9 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
APIPQ96GX9 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
APIPQ96GX9 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
APIPQ96GX9 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
APIPQ96GX9 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
APIPQ96GX9 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
APIPQ96GX9 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
APIPQ96GX9 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
APIPQ96GX9 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
APIPQ96GX9 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
APIPQ96GX9 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC20.87■□□□□ 0.93
APIPQ96GX9 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
APIPQ96GX9 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
APIPQ96GX9 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
APIPQ96GX9 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
APIPQ96GX9 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
APIPQ96GX9 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
APIPQ96GX9 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
APIPQ96GX9 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
APIPQ96GX9 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
APIPQ96GX9 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
APIPQ96GX9 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
APIPQ96GX9 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
APIPQ96GX9 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
APIPQ96GX9 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
APIPQ96GX9 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
APIPQ96GX9 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
APIPQ96GX9 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
APIPQ96GX9 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
APIPQ96GX9 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
APIPQ96GX9 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
APIPQ96GX9 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
APIPQ96GX9 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
APIPQ96GX9 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
APIPQ96GX9 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
APIPQ96GX9 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
APIPQ96GX9 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
APIPQ96GX9 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
APIPQ96GX9 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
APIPQ96GX9 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
APIPQ96GX9 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
APIPQ96GX9 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
APIPQ96GX9 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
APIPQ96GX9 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms