Protein–RNA interactions for Protein: Q96FV3

TSPAN17, Tetraspanin-17, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN17Q96FV3 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TSPAN17Q96FV3 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TSPAN17Q96FV3 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TSPAN17Q96FV3 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TSPAN17Q96FV3 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TSPAN17Q96FV3 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
TSPAN17Q96FV3 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TSPAN17Q96FV3 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TSPAN17Q96FV3 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TSPAN17Q96FV3 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TSPAN17Q96FV3 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TSPAN17Q96FV3 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TSPAN17Q96FV3 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TSPAN17Q96FV3 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TSPAN17Q96FV3 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TSPAN17Q96FV3 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TSPAN17Q96FV3 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TSPAN17Q96FV3 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TSPAN17Q96FV3 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TSPAN17Q96FV3 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TSPAN17Q96FV3 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TSPAN17Q96FV3 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TSPAN17Q96FV3 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TSPAN17Q96FV3 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TSPAN17Q96FV3 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TSPAN17Q96FV3 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TSPAN17Q96FV3 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TSPAN17Q96FV3 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TSPAN17Q96FV3 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TSPAN17Q96FV3 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TSPAN17Q96FV3 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TSPAN17Q96FV3 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TSPAN17Q96FV3 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
TSPAN17Q96FV3 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TSPAN17Q96FV3 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TSPAN17Q96FV3 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TSPAN17Q96FV3 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TSPAN17Q96FV3 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TSPAN17Q96FV3 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TSPAN17Q96FV3 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
TSPAN17Q96FV3 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TSPAN17Q96FV3 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
TSPAN17Q96FV3 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TSPAN17Q96FV3 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TSPAN17Q96FV3 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TSPAN17Q96FV3 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TSPAN17Q96FV3 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TSPAN17Q96FV3 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TSPAN17Q96FV3 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TSPAN17Q96FV3 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TSPAN17Q96FV3 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TSPAN17Q96FV3 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TSPAN17Q96FV3 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TSPAN17Q96FV3 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TSPAN17Q96FV3 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TSPAN17Q96FV3 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TSPAN17Q96FV3 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TSPAN17Q96FV3 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TSPAN17Q96FV3 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TSPAN17Q96FV3 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TSPAN17Q96FV3 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TSPAN17Q96FV3 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TSPAN17Q96FV3 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TSPAN17Q96FV3 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TSPAN17Q96FV3 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TSPAN17Q96FV3 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TSPAN17Q96FV3 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TSPAN17Q96FV3 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TSPAN17Q96FV3 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
TSPAN17Q96FV3 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TSPAN17Q96FV3 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TSPAN17Q96FV3 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TSPAN17Q96FV3 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TSPAN17Q96FV3 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TSPAN17Q96FV3 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TSPAN17Q96FV3 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TSPAN17Q96FV3 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TSPAN17Q96FV3 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
TSPAN17Q96FV3 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TSPAN17Q96FV3 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TSPAN17Q96FV3 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TSPAN17Q96FV3 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TSPAN17Q96FV3 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TSPAN17Q96FV3 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
TSPAN17Q96FV3 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TSPAN17Q96FV3 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TSPAN17Q96FV3 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TSPAN17Q96FV3 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TSPAN17Q96FV3 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TSPAN17Q96FV3 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TSPAN17Q96FV3 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TSPAN17Q96FV3 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TSPAN17Q96FV3 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TSPAN17Q96FV3 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TSPAN17Q96FV3 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TSPAN17Q96FV3 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TSPAN17Q96FV3 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TSPAN17Q96FV3 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TSPAN17Q96FV3 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TSPAN17Q96FV3 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms