Protein–RNA interactions for Protein: Q96DC8

ECHDC3, Enoyl-CoA hydratase domain-containing protein 3, mitochondrial, humanhuman

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Length 303 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHDC3Q96DC8 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ECHDC3Q96DC8 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ECHDC3Q96DC8 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ECHDC3Q96DC8 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ECHDC3Q96DC8 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ECHDC3Q96DC8 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ECHDC3Q96DC8 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ECHDC3Q96DC8 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ECHDC3Q96DC8 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ECHDC3Q96DC8 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
ECHDC3Q96DC8 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ECHDC3Q96DC8 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ECHDC3Q96DC8 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ECHDC3Q96DC8 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ECHDC3Q96DC8 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
ECHDC3Q96DC8 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ECHDC3Q96DC8 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ECHDC3Q96DC8 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ECHDC3Q96DC8 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ECHDC3Q96DC8 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ECHDC3Q96DC8 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ECHDC3Q96DC8 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ECHDC3Q96DC8 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ECHDC3Q96DC8 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ECHDC3Q96DC8 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ECHDC3Q96DC8 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
ECHDC3Q96DC8 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ECHDC3Q96DC8 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ECHDC3Q96DC8 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ECHDC3Q96DC8 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ECHDC3Q96DC8 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ECHDC3Q96DC8 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ECHDC3Q96DC8 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ECHDC3Q96DC8 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ECHDC3Q96DC8 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ECHDC3Q96DC8 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ECHDC3Q96DC8 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ECHDC3Q96DC8 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
ECHDC3Q96DC8 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
ECHDC3Q96DC8 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
ECHDC3Q96DC8 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
ECHDC3Q96DC8 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ECHDC3Q96DC8 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ECHDC3Q96DC8 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ECHDC3Q96DC8 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
ECHDC3Q96DC8 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ECHDC3Q96DC8 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ECHDC3Q96DC8 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ECHDC3Q96DC8 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ECHDC3Q96DC8 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ECHDC3Q96DC8 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ECHDC3Q96DC8 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ECHDC3Q96DC8 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ECHDC3Q96DC8 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
ECHDC3Q96DC8 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ECHDC3Q96DC8 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ECHDC3Q96DC8 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ECHDC3Q96DC8 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ECHDC3Q96DC8 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ECHDC3Q96DC8 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ECHDC3Q96DC8 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ECHDC3Q96DC8 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ECHDC3Q96DC8 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ECHDC3Q96DC8 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ECHDC3Q96DC8 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
ECHDC3Q96DC8 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ECHDC3Q96DC8 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ECHDC3Q96DC8 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ECHDC3Q96DC8 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ECHDC3Q96DC8 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
ECHDC3Q96DC8 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ECHDC3Q96DC8 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
ECHDC3Q96DC8 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ECHDC3Q96DC8 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ECHDC3Q96DC8 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ECHDC3Q96DC8 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ECHDC3Q96DC8 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ECHDC3Q96DC8 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ECHDC3Q96DC8 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ECHDC3Q96DC8 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ECHDC3Q96DC8 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ECHDC3Q96DC8 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ECHDC3Q96DC8 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ECHDC3Q96DC8 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ECHDC3Q96DC8 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ECHDC3Q96DC8 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ECHDC3Q96DC8 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ECHDC3Q96DC8 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ECHDC3Q96DC8 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ECHDC3Q96DC8 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ECHDC3Q96DC8 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ECHDC3Q96DC8 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
ECHDC3Q96DC8 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ECHDC3Q96DC8 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ECHDC3Q96DC8 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
ECHDC3Q96DC8 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
ECHDC3Q96DC8 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ECHDC3Q96DC8 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ECHDC3Q96DC8 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ECHDC3Q96DC8 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
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