Protein–RNA interactions for Protein: Q96CW5

TUBGCP3, Gamma-tubulin complex component 3, humanhuman

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBGCP3Q96CW5 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TUBGCP3Q96CW5 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TUBGCP3Q96CW5 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
TUBGCP3Q96CW5 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
TUBGCP3Q96CW5 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TUBGCP3Q96CW5 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TUBGCP3Q96CW5 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TUBGCP3Q96CW5 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TUBGCP3Q96CW5 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TUBGCP3Q96CW5 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TUBGCP3Q96CW5 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TUBGCP3Q96CW5 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TUBGCP3Q96CW5 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TUBGCP3Q96CW5 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TUBGCP3Q96CW5 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TUBGCP3Q96CW5 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TUBGCP3Q96CW5 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TUBGCP3Q96CW5 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TUBGCP3Q96CW5 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TUBGCP3Q96CW5 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TUBGCP3Q96CW5 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
TUBGCP3Q96CW5 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TUBGCP3Q96CW5 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
TUBGCP3Q96CW5 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
TUBGCP3Q96CW5 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TUBGCP3Q96CW5 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TUBGCP3Q96CW5 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
TUBGCP3Q96CW5 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TUBGCP3Q96CW5 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TUBGCP3Q96CW5 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TUBGCP3Q96CW5 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TUBGCP3Q96CW5 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TUBGCP3Q96CW5 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TUBGCP3Q96CW5 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TUBGCP3Q96CW5 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TUBGCP3Q96CW5 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TUBGCP3Q96CW5 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TUBGCP3Q96CW5 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TUBGCP3Q96CW5 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TUBGCP3Q96CW5 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TUBGCP3Q96CW5 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TUBGCP3Q96CW5 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TUBGCP3Q96CW5 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
TUBGCP3Q96CW5 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TUBGCP3Q96CW5 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TUBGCP3Q96CW5 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TUBGCP3Q96CW5 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TUBGCP3Q96CW5 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TUBGCP3Q96CW5 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TUBGCP3Q96CW5 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TUBGCP3Q96CW5 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TUBGCP3Q96CW5 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TUBGCP3Q96CW5 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TUBGCP3Q96CW5 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TUBGCP3Q96CW5 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TUBGCP3Q96CW5 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TUBGCP3Q96CW5 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TUBGCP3Q96CW5 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TUBGCP3Q96CW5 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TUBGCP3Q96CW5 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TUBGCP3Q96CW5 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TUBGCP3Q96CW5 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TUBGCP3Q96CW5 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TUBGCP3Q96CW5 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TUBGCP3Q96CW5 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TUBGCP3Q96CW5 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TUBGCP3Q96CW5 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
TUBGCP3Q96CW5 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TUBGCP3Q96CW5 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TUBGCP3Q96CW5 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TUBGCP3Q96CW5 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TUBGCP3Q96CW5 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TUBGCP3Q96CW5 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TUBGCP3Q96CW5 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TUBGCP3Q96CW5 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TUBGCP3Q96CW5 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TUBGCP3Q96CW5 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TUBGCP3Q96CW5 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TUBGCP3Q96CW5 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TUBGCP3Q96CW5 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TUBGCP3Q96CW5 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TUBGCP3Q96CW5 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TUBGCP3Q96CW5 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TUBGCP3Q96CW5 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TUBGCP3Q96CW5 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TUBGCP3Q96CW5 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TUBGCP3Q96CW5 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TUBGCP3Q96CW5 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TUBGCP3Q96CW5 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TUBGCP3Q96CW5 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TUBGCP3Q96CW5 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
TUBGCP3Q96CW5 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TUBGCP3Q96CW5 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TUBGCP3Q96CW5 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TUBGCP3Q96CW5 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TUBGCP3Q96CW5 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TUBGCP3Q96CW5 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TUBGCP3Q96CW5 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TUBGCP3Q96CW5 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TUBGCP3Q96CW5 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms