Protein–RNA interactions for Protein: Q96A29

SLC35C1, GDP-fucose transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC35C1Q96A29 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC35C1Q96A29 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC35C1Q96A29 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC35C1Q96A29 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC35C1Q96A29 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC35C1Q96A29 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC35C1Q96A29 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC35C1Q96A29 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC35C1Q96A29 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC35C1Q96A29 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC35C1Q96A29 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC35C1Q96A29 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC35C1Q96A29 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC35C1Q96A29 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC35C1Q96A29 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC35C1Q96A29 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC35C1Q96A29 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC35C1Q96A29 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC35C1Q96A29 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC35C1Q96A29 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC35C1Q96A29 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC35C1Q96A29 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC35C1Q96A29 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC35C1Q96A29 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC35C1Q96A29 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC35C1Q96A29 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC35C1Q96A29 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC35C1Q96A29 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC35C1Q96A29 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC35C1Q96A29 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC35C1Q96A29 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC35C1Q96A29 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC35C1Q96A29 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC35C1Q96A29 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC35C1Q96A29 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC35C1Q96A29 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC35C1Q96A29 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC35C1Q96A29 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC35C1Q96A29 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC35C1Q96A29 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC35C1Q96A29 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC35C1Q96A29 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC35C1Q96A29 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
SLC35C1Q96A29 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
SLC35C1Q96A29 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC35C1Q96A29 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC35C1Q96A29 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC35C1Q96A29 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC35C1Q96A29 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC35C1Q96A29 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC35C1Q96A29 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC35C1Q96A29 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC35C1Q96A29 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC35C1Q96A29 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC35C1Q96A29 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC35C1Q96A29 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC35C1Q96A29 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC35C1Q96A29 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC35C1Q96A29 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC35C1Q96A29 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC35C1Q96A29 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC35C1Q96A29 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC35C1Q96A29 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC35C1Q96A29 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC35C1Q96A29 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC35C1Q96A29 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC35C1Q96A29 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC35C1Q96A29 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC35C1Q96A29 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC35C1Q96A29 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC35C1Q96A29 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC35C1Q96A29 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC35C1Q96A29 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC35C1Q96A29 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC35C1Q96A29 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC35C1Q96A29 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC35C1Q96A29 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC35C1Q96A29 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC35C1Q96A29 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC35C1Q96A29 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC35C1Q96A29 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC35C1Q96A29 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC35C1Q96A29 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC35C1Q96A29 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC35C1Q96A29 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC35C1Q96A29 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC35C1Q96A29 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC35C1Q96A29 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC35C1Q96A29 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC35C1Q96A29 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC35C1Q96A29 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC35C1Q96A29 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC35C1Q96A29 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC35C1Q96A29 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC35C1Q96A29 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC35C1Q96A29 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC35C1Q96A29 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC35C1Q96A29 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC35C1Q96A29 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC35C1Q96A29 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms