Protein–RNA interactions for Protein: Q969V6

MKL1, MKL/myocardin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 931 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKL1Q969V6 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MKL1Q969V6 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MKL1Q969V6 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MKL1Q969V6 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MKL1Q969V6 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MKL1Q969V6 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MKL1Q969V6 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MKL1Q969V6 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MKL1Q969V6 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MKL1Q969V6 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MKL1Q969V6 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MKL1Q969V6 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MKL1Q969V6 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MKL1Q969V6 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MKL1Q969V6 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MKL1Q969V6 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MKL1Q969V6 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MKL1Q969V6 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MKL1Q969V6 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MKL1Q969V6 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
MKL1Q969V6 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MKL1Q969V6 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MKL1Q969V6 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MKL1Q969V6 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MKL1Q969V6 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MKL1Q969V6 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MKL1Q969V6 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MKL1Q969V6 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MKL1Q969V6 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MKL1Q969V6 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MKL1Q969V6 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MKL1Q969V6 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MKL1Q969V6 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MKL1Q969V6 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MKL1Q969V6 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MKL1Q969V6 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MKL1Q969V6 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MKL1Q969V6 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MKL1Q969V6 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MKL1Q969V6 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MKL1Q969V6 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
MKL1Q969V6 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MKL1Q969V6 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
MKL1Q969V6 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
MKL1Q969V6 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
MKL1Q969V6 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MKL1Q969V6 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MKL1Q969V6 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MKL1Q969V6 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MKL1Q969V6 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MKL1Q969V6 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
MKL1Q969V6 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
MKL1Q969V6 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MKL1Q969V6 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MKL1Q969V6 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MKL1Q969V6 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MKL1Q969V6 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MKL1Q969V6 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MKL1Q969V6 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MKL1Q969V6 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MKL1Q969V6 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MKL1Q969V6 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MKL1Q969V6 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MKL1Q969V6 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MKL1Q969V6 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MKL1Q969V6 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MKL1Q969V6 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MKL1Q969V6 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MKL1Q969V6 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MKL1Q969V6 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MKL1Q969V6 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MKL1Q969V6 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MKL1Q969V6 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MKL1Q969V6 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MKL1Q969V6 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MKL1Q969V6 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MKL1Q969V6 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MKL1Q969V6 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MKL1Q969V6 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MKL1Q969V6 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MKL1Q969V6 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MKL1Q969V6 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MKL1Q969V6 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MKL1Q969V6 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MKL1Q969V6 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MKL1Q969V6 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MKL1Q969V6 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MKL1Q969V6 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MKL1Q969V6 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MKL1Q969V6 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MKL1Q969V6 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MKL1Q969V6 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MKL1Q969V6 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MKL1Q969V6 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
MKL1Q969V6 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MKL1Q969V6 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MKL1Q969V6 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MKL1Q969V6 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MKL1Q969V6 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MKL1Q969V6 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms