Protein–RNA interactions for Protein: Q93084

ATP2A3, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2A3Q93084 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP2A3Q93084 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP2A3Q93084 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP2A3Q93084 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP2A3Q93084 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP2A3Q93084 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP2A3Q93084 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ATP2A3Q93084 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ATP2A3Q93084 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ATP2A3Q93084 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ATP2A3Q93084 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ATP2A3Q93084 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ATP2A3Q93084 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ATP2A3Q93084 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
ATP2A3Q93084 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATP2A3Q93084 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATP2A3Q93084 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATP2A3Q93084 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATP2A3Q93084 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATP2A3Q93084 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATP2A3Q93084 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATP2A3Q93084 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATP2A3Q93084 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATP2A3Q93084 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATP2A3Q93084 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATP2A3Q93084 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATP2A3Q93084 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP2A3Q93084 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP2A3Q93084 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP2A3Q93084 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP2A3Q93084 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP2A3Q93084 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP2A3Q93084 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP2A3Q93084 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP2A3Q93084 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP2A3Q93084 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP2A3Q93084 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP2A3Q93084 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP2A3Q93084 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP2A3Q93084 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP2A3Q93084 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP2A3Q93084 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP2A3Q93084 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP2A3Q93084 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP2A3Q93084 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP2A3Q93084 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP2A3Q93084 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP2A3Q93084 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP2A3Q93084 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP2A3Q93084 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP2A3Q93084 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP2A3Q93084 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP2A3Q93084 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP2A3Q93084 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP2A3Q93084 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP2A3Q93084 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP2A3Q93084 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP2A3Q93084 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP2A3Q93084 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP2A3Q93084 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP2A3Q93084 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP2A3Q93084 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP2A3Q93084 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP2A3Q93084 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP2A3Q93084 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP2A3Q93084 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP2A3Q93084 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP2A3Q93084 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP2A3Q93084 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP2A3Q93084 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP2A3Q93084 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP2A3Q93084 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP2A3Q93084 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP2A3Q93084 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP2A3Q93084 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP2A3Q93084 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP2A3Q93084 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP2A3Q93084 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP2A3Q93084 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP2A3Q93084 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP2A3Q93084 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP2A3Q93084 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP2A3Q93084 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP2A3Q93084 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP2A3Q93084 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP2A3Q93084 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP2A3Q93084 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP2A3Q93084 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP2A3Q93084 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP2A3Q93084 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP2A3Q93084 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP2A3Q93084 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP2A3Q93084 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP2A3Q93084 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP2A3Q93084 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP2A3Q93084 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP2A3Q93084 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP2A3Q93084 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP2A3Q93084 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP2A3Q93084 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms