Protein–RNA interactions for Protein: Q92764

KRT35, Keratin, type I cuticular Ha5, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT35Q92764 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KRT35Q92764 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KRT35Q92764 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KRT35Q92764 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KRT35Q92764 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KRT35Q92764 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KRT35Q92764 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KRT35Q92764 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KRT35Q92764 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KRT35Q92764 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KRT35Q92764 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KRT35Q92764 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KRT35Q92764 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KRT35Q92764 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KRT35Q92764 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KRT35Q92764 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
KRT35Q92764 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
KRT35Q92764 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
KRT35Q92764 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
KRT35Q92764 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KRT35Q92764 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KRT35Q92764 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KRT35Q92764 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KRT35Q92764 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KRT35Q92764 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
KRT35Q92764 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KRT35Q92764 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRT35Q92764 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRT35Q92764 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRT35Q92764 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRT35Q92764 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRT35Q92764 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRT35Q92764 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRT35Q92764 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRT35Q92764 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRT35Q92764 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRT35Q92764 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRT35Q92764 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRT35Q92764 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRT35Q92764 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRT35Q92764 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRT35Q92764 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRT35Q92764 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRT35Q92764 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRT35Q92764 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
KRT35Q92764 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRT35Q92764 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT35Q92764 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT35Q92764 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT35Q92764 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT35Q92764 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT35Q92764 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT35Q92764 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT35Q92764 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT35Q92764 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT35Q92764 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT35Q92764 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT35Q92764 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT35Q92764 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT35Q92764 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT35Q92764 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT35Q92764 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT35Q92764 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KRT35Q92764 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KRT35Q92764 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KRT35Q92764 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KRT35Q92764 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KRT35Q92764 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KRT35Q92764 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KRT35Q92764 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
KRT35Q92764 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KRT35Q92764 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KRT35Q92764 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
KRT35Q92764 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
KRT35Q92764 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
KRT35Q92764 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT35Q92764 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT35Q92764 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT35Q92764 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT35Q92764 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT35Q92764 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT35Q92764 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT35Q92764 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT35Q92764 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT35Q92764 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT35Q92764 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT35Q92764 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT35Q92764 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT35Q92764 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT35Q92764 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT35Q92764 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT35Q92764 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT35Q92764 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT35Q92764 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT35Q92764 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT35Q92764 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT35Q92764 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT35Q92764 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT35Q92764 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT35Q92764 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms