Protein–RNA interactions for Protein: Q92541

RTF1, RNA polymerase-associated protein RTF1 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTF1Q92541 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
RTF1Q92541 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
RTF1Q92541 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
RTF1Q92541 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
RTF1Q92541 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
RTF1Q92541 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
RTF1Q92541 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
RTF1Q92541 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RTF1Q92541 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RTF1Q92541 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
RTF1Q92541 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
RTF1Q92541 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC28.57■■■□□ 2.16
RTF1Q92541 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RTF1Q92541 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RTF1Q92541 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RTF1Q92541 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RTF1Q92541 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
RTF1Q92541 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RTF1Q92541 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
RTF1Q92541 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RTF1Q92541 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RTF1Q92541 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
RTF1Q92541 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RTF1Q92541 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RTF1Q92541 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RTF1Q92541 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RTF1Q92541 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RTF1Q92541 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RTF1Q92541 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
RTF1Q92541 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RTF1Q92541 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
RTF1Q92541 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
RTF1Q92541 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
RTF1Q92541 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RTF1Q92541 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
RTF1Q92541 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RTF1Q92541 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
RTF1Q92541 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RTF1Q92541 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RTF1Q92541 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
RTF1Q92541 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
RTF1Q92541 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RTF1Q92541 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
RTF1Q92541 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RTF1Q92541 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RTF1Q92541 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RTF1Q92541 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
RTF1Q92541 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
RTF1Q92541 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
RTF1Q92541 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
RTF1Q92541 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
RTF1Q92541 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RTF1Q92541 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
RTF1Q92541 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RTF1Q92541 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
RTF1Q92541 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RTF1Q92541 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
RTF1Q92541 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RTF1Q92541 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RTF1Q92541 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
RTF1Q92541 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
RTF1Q92541 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RTF1Q92541 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
RTF1Q92541 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
RTF1Q92541 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
RTF1Q92541 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
RTF1Q92541 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
RTF1Q92541 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
RTF1Q92541 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
RTF1Q92541 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
RTF1Q92541 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
RTF1Q92541 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
RTF1Q92541 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
RTF1Q92541 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
RTF1Q92541 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
RTF1Q92541 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
RTF1Q92541 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RTF1Q92541 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
RTF1Q92541 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
RTF1Q92541 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RTF1Q92541 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RTF1Q92541 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RTF1Q92541 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RTF1Q92541 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RTF1Q92541 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
RTF1Q92541 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RTF1Q92541 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
RTF1Q92541 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
RTF1Q92541 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RTF1Q92541 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RTF1Q92541 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RTF1Q92541 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
RTF1Q92541 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
RTF1Q92541 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
RTF1Q92541 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
RTF1Q92541 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
RTF1Q92541 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
RTF1Q92541 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
RTF1Q92541 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
RTF1Q92541 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms