Protein–RNA interactions for Protein: Q8WYN0

ATG4A, Cysteine protease ATG4A, humanhuman

Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4AQ8WYN0 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATG4AQ8WYN0 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATG4AQ8WYN0 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATG4AQ8WYN0 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATG4AQ8WYN0 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATG4AQ8WYN0 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATG4AQ8WYN0 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATG4AQ8WYN0 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATG4AQ8WYN0 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATG4AQ8WYN0 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATG4AQ8WYN0 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATG4AQ8WYN0 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ATG4AQ8WYN0 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATG4AQ8WYN0 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATG4AQ8WYN0 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATG4AQ8WYN0 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATG4AQ8WYN0 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATG4AQ8WYN0 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATG4AQ8WYN0 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATG4AQ8WYN0 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATG4AQ8WYN0 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATG4AQ8WYN0 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATG4AQ8WYN0 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATG4AQ8WYN0 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATG4AQ8WYN0 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATG4AQ8WYN0 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATG4AQ8WYN0 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ATG4AQ8WYN0 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATG4AQ8WYN0 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATG4AQ8WYN0 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATG4AQ8WYN0 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATG4AQ8WYN0 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATG4AQ8WYN0 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATG4AQ8WYN0 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATG4AQ8WYN0 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATG4AQ8WYN0 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATG4AQ8WYN0 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATG4AQ8WYN0 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATG4AQ8WYN0 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATG4AQ8WYN0 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATG4AQ8WYN0 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATG4AQ8WYN0 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATG4AQ8WYN0 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATG4AQ8WYN0 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATG4AQ8WYN0 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATG4AQ8WYN0 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ATG4AQ8WYN0 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ATG4AQ8WYN0 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ATG4AQ8WYN0 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATG4AQ8WYN0 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATG4AQ8WYN0 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ATG4AQ8WYN0 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATG4AQ8WYN0 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATG4AQ8WYN0 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATG4AQ8WYN0 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATG4AQ8WYN0 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATG4AQ8WYN0 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATG4AQ8WYN0 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ATG4AQ8WYN0 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ATG4AQ8WYN0 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ATG4AQ8WYN0 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ATG4AQ8WYN0 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATG4AQ8WYN0 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATG4AQ8WYN0 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATG4AQ8WYN0 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATG4AQ8WYN0 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATG4AQ8WYN0 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATG4AQ8WYN0 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATG4AQ8WYN0 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATG4AQ8WYN0 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATG4AQ8WYN0 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATG4AQ8WYN0 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATG4AQ8WYN0 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATG4AQ8WYN0 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATG4AQ8WYN0 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATG4AQ8WYN0 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATG4AQ8WYN0 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
ATG4AQ8WYN0 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATG4AQ8WYN0 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATG4AQ8WYN0 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATG4AQ8WYN0 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATG4AQ8WYN0 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATG4AQ8WYN0 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATG4AQ8WYN0 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATG4AQ8WYN0 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATG4AQ8WYN0 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATG4AQ8WYN0 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATG4AQ8WYN0 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATG4AQ8WYN0 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATG4AQ8WYN0 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATG4AQ8WYN0 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATG4AQ8WYN0 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATG4AQ8WYN0 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATG4AQ8WYN0 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATG4AQ8WYN0 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATG4AQ8WYN0 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
ATG4AQ8WYN0 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATG4AQ8WYN0 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATG4AQ8WYN0 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATG4AQ8WYN0 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms