Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWY3

PRPF31, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp31, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF31Q8WWY3 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRPF31Q8WWY3 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRPF31Q8WWY3 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRPF31Q8WWY3 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRPF31Q8WWY3 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRPF31Q8WWY3 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRPF31Q8WWY3 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRPF31Q8WWY3 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRPF31Q8WWY3 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRPF31Q8WWY3 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRPF31Q8WWY3 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PRPF31Q8WWY3 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRPF31Q8WWY3 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRPF31Q8WWY3 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRPF31Q8WWY3 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRPF31Q8WWY3 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRPF31Q8WWY3 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRPF31Q8WWY3 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRPF31Q8WWY3 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRPF31Q8WWY3 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRPF31Q8WWY3 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PRPF31Q8WWY3 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRPF31Q8WWY3 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRPF31Q8WWY3 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PRPF31Q8WWY3 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRPF31Q8WWY3 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRPF31Q8WWY3 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRPF31Q8WWY3 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRPF31Q8WWY3 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRPF31Q8WWY3 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRPF31Q8WWY3 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRPF31Q8WWY3 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRPF31Q8WWY3 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRPF31Q8WWY3 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRPF31Q8WWY3 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
PRPF31Q8WWY3 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PRPF31Q8WWY3 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRPF31Q8WWY3 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRPF31Q8WWY3 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRPF31Q8WWY3 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRPF31Q8WWY3 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRPF31Q8WWY3 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRPF31Q8WWY3 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRPF31Q8WWY3 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRPF31Q8WWY3 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PRPF31Q8WWY3 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRPF31Q8WWY3 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRPF31Q8WWY3 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRPF31Q8WWY3 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRPF31Q8WWY3 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRPF31Q8WWY3 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRPF31Q8WWY3 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRPF31Q8WWY3 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRPF31Q8WWY3 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRPF31Q8WWY3 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRPF31Q8WWY3 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRPF31Q8WWY3 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRPF31Q8WWY3 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRPF31Q8WWY3 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRPF31Q8WWY3 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRPF31Q8WWY3 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PRPF31Q8WWY3 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRPF31Q8WWY3 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PRPF31Q8WWY3 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PRPF31Q8WWY3 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PRPF31Q8WWY3 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PRPF31Q8WWY3 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PRPF31Q8WWY3 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PRPF31Q8WWY3 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRPF31Q8WWY3 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRPF31Q8WWY3 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRPF31Q8WWY3 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PRPF31Q8WWY3 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRPF31Q8WWY3 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRPF31Q8WWY3 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRPF31Q8WWY3 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PRPF31Q8WWY3 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRPF31Q8WWY3 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRPF31Q8WWY3 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRPF31Q8WWY3 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRPF31Q8WWY3 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRPF31Q8WWY3 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRPF31Q8WWY3 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PRPF31Q8WWY3 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRPF31Q8WWY3 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRPF31Q8WWY3 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRPF31Q8WWY3 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRPF31Q8WWY3 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRPF31Q8WWY3 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRPF31Q8WWY3 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRPF31Q8WWY3 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRPF31Q8WWY3 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PRPF31Q8WWY3 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRPF31Q8WWY3 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRPF31Q8WWY3 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRPF31Q8WWY3 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRPF31Q8WWY3 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRPF31Q8WWY3 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRPF31Q8WWY3 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRPF31Q8WWY3 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 265.5 ms