Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW27

APOBEC4, Putative C->U-editing enzyme APOBEC-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC4Q8WW27 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
APOBEC4Q8WW27 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
APOBEC4Q8WW27 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
APOBEC4Q8WW27 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
APOBEC4Q8WW27 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
APOBEC4Q8WW27 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
APOBEC4Q8WW27 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
APOBEC4Q8WW27 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
APOBEC4Q8WW27 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
APOBEC4Q8WW27 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
APOBEC4Q8WW27 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
APOBEC4Q8WW27 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
APOBEC4Q8WW27 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
APOBEC4Q8WW27 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
APOBEC4Q8WW27 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.87■□□□□ 0.93
APOBEC4Q8WW27 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
APOBEC4Q8WW27 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
APOBEC4Q8WW27 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
APOBEC4Q8WW27 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
APOBEC4Q8WW27 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
APOBEC4Q8WW27 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
APOBEC4Q8WW27 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
APOBEC4Q8WW27 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
APOBEC4Q8WW27 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
APOBEC4Q8WW27 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
APOBEC4Q8WW27 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
APOBEC4Q8WW27 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
APOBEC4Q8WW27 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
APOBEC4Q8WW27 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
APOBEC4Q8WW27 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
APOBEC4Q8WW27 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
APOBEC4Q8WW27 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
APOBEC4Q8WW27 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
APOBEC4Q8WW27 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
APOBEC4Q8WW27 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
APOBEC4Q8WW27 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
APOBEC4Q8WW27 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
APOBEC4Q8WW27 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
APOBEC4Q8WW27 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
APOBEC4Q8WW27 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
APOBEC4Q8WW27 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
APOBEC4Q8WW27 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
APOBEC4Q8WW27 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
APOBEC4Q8WW27 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
APOBEC4Q8WW27 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
APOBEC4Q8WW27 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
APOBEC4Q8WW27 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
APOBEC4Q8WW27 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
APOBEC4Q8WW27 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
APOBEC4Q8WW27 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
APOBEC4Q8WW27 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
APOBEC4Q8WW27 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
APOBEC4Q8WW27 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
APOBEC4Q8WW27 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
APOBEC4Q8WW27 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
APOBEC4Q8WW27 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
APOBEC4Q8WW27 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
APOBEC4Q8WW27 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
APOBEC4Q8WW27 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
APOBEC4Q8WW27 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
APOBEC4Q8WW27 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
APOBEC4Q8WW27 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
APOBEC4Q8WW27 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
APOBEC4Q8WW27 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
APOBEC4Q8WW27 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
APOBEC4Q8WW27 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
APOBEC4Q8WW27 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
APOBEC4Q8WW27 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
APOBEC4Q8WW27 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
APOBEC4Q8WW27 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
APOBEC4Q8WW27 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
APOBEC4Q8WW27 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
APOBEC4Q8WW27 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
APOBEC4Q8WW27 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
APOBEC4Q8WW27 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
APOBEC4Q8WW27 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
APOBEC4Q8WW27 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
APOBEC4Q8WW27 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
APOBEC4Q8WW27 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
APOBEC4Q8WW27 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
APOBEC4Q8WW27 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
APOBEC4Q8WW27 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
APOBEC4Q8WW27 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
APOBEC4Q8WW27 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
APOBEC4Q8WW27 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
APOBEC4Q8WW27 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
APOBEC4Q8WW27 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
APOBEC4Q8WW27 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
APOBEC4Q8WW27 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
APOBEC4Q8WW27 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
APOBEC4Q8WW27 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
APOBEC4Q8WW27 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
APOBEC4Q8WW27 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
APOBEC4Q8WW27 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
APOBEC4Q8WW27 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
APOBEC4Q8WW27 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
APOBEC4Q8WW27 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
APOBEC4Q8WW27 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
APOBEC4Q8WW27 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
APOBEC4Q8WW27 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms