Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW27

APOBEC4, Putative C->U-editing enzyme APOBEC-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC4Q8WW27 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
APOBEC4Q8WW27 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
APOBEC4Q8WW27 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
APOBEC4Q8WW27 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
APOBEC4Q8WW27 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
APOBEC4Q8WW27 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
APOBEC4Q8WW27 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
APOBEC4Q8WW27 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
APOBEC4Q8WW27 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
APOBEC4Q8WW27 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
APOBEC4Q8WW27 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
APOBEC4Q8WW27 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
APOBEC4Q8WW27 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
APOBEC4Q8WW27 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
APOBEC4Q8WW27 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.87■□□□□ 0.93
APOBEC4Q8WW27 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
APOBEC4Q8WW27 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
APOBEC4Q8WW27 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
APOBEC4Q8WW27 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
APOBEC4Q8WW27 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
APOBEC4Q8WW27 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
APOBEC4Q8WW27 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
APOBEC4Q8WW27 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
APOBEC4Q8WW27 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
APOBEC4Q8WW27 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
APOBEC4Q8WW27 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
APOBEC4Q8WW27 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
APOBEC4Q8WW27 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
APOBEC4Q8WW27 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
APOBEC4Q8WW27 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
APOBEC4Q8WW27 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
APOBEC4Q8WW27 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
APOBEC4Q8WW27 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
APOBEC4Q8WW27 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
APOBEC4Q8WW27 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
APOBEC4Q8WW27 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
APOBEC4Q8WW27 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
APOBEC4Q8WW27 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
APOBEC4Q8WW27 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
APOBEC4Q8WW27 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
APOBEC4Q8WW27 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
APOBEC4Q8WW27 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
APOBEC4Q8WW27 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
APOBEC4Q8WW27 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
APOBEC4Q8WW27 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
APOBEC4Q8WW27 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
APOBEC4Q8WW27 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
APOBEC4Q8WW27 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
APOBEC4Q8WW27 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
APOBEC4Q8WW27 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
APOBEC4Q8WW27 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
APOBEC4Q8WW27 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
APOBEC4Q8WW27 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
APOBEC4Q8WW27 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
APOBEC4Q8WW27 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
APOBEC4Q8WW27 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
APOBEC4Q8WW27 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
APOBEC4Q8WW27 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
APOBEC4Q8WW27 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
APOBEC4Q8WW27 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
APOBEC4Q8WW27 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
APOBEC4Q8WW27 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
APOBEC4Q8WW27 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
APOBEC4Q8WW27 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
APOBEC4Q8WW27 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
APOBEC4Q8WW27 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
APOBEC4Q8WW27 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
APOBEC4Q8WW27 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
APOBEC4Q8WW27 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
APOBEC4Q8WW27 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
APOBEC4Q8WW27 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
APOBEC4Q8WW27 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
APOBEC4Q8WW27 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
APOBEC4Q8WW27 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
APOBEC4Q8WW27 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
APOBEC4Q8WW27 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
APOBEC4Q8WW27 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
APOBEC4Q8WW27 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
APOBEC4Q8WW27 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
APOBEC4Q8WW27 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
APOBEC4Q8WW27 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
APOBEC4Q8WW27 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
APOBEC4Q8WW27 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
APOBEC4Q8WW27 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
APOBEC4Q8WW27 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
APOBEC4Q8WW27 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
APOBEC4Q8WW27 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
APOBEC4Q8WW27 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
APOBEC4Q8WW27 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
APOBEC4Q8WW27 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
APOBEC4Q8WW27 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
APOBEC4Q8WW27 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
APOBEC4Q8WW27 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
APOBEC4Q8WW27 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
APOBEC4Q8WW27 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
APOBEC4Q8WW27 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
APOBEC4Q8WW27 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
APOBEC4Q8WW27 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
APOBEC4Q8WW27 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
APOBEC4Q8WW27 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms