Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVJ9

TWIST2, Twist-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWIST2Q8WVJ9 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TWIST2Q8WVJ9 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TWIST2Q8WVJ9 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TWIST2Q8WVJ9 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TWIST2Q8WVJ9 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TWIST2Q8WVJ9 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TWIST2Q8WVJ9 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
TWIST2Q8WVJ9 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TWIST2Q8WVJ9 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TWIST2Q8WVJ9 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TWIST2Q8WVJ9 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TWIST2Q8WVJ9 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TWIST2Q8WVJ9 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TWIST2Q8WVJ9 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
TWIST2Q8WVJ9 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TWIST2Q8WVJ9 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TWIST2Q8WVJ9 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TWIST2Q8WVJ9 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
TWIST2Q8WVJ9 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TWIST2Q8WVJ9 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TWIST2Q8WVJ9 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TWIST2Q8WVJ9 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TWIST2Q8WVJ9 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TWIST2Q8WVJ9 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TWIST2Q8WVJ9 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TWIST2Q8WVJ9 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TWIST2Q8WVJ9 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TWIST2Q8WVJ9 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TWIST2Q8WVJ9 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TWIST2Q8WVJ9 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TWIST2Q8WVJ9 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
TWIST2Q8WVJ9 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
TWIST2Q8WVJ9 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
TWIST2Q8WVJ9 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TWIST2Q8WVJ9 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TWIST2Q8WVJ9 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TWIST2Q8WVJ9 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TWIST2Q8WVJ9 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TWIST2Q8WVJ9 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TWIST2Q8WVJ9 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TWIST2Q8WVJ9 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TWIST2Q8WVJ9 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TWIST2Q8WVJ9 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TWIST2Q8WVJ9 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
TWIST2Q8WVJ9 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TWIST2Q8WVJ9 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TWIST2Q8WVJ9 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TWIST2Q8WVJ9 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TWIST2Q8WVJ9 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TWIST2Q8WVJ9 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TWIST2Q8WVJ9 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TWIST2Q8WVJ9 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TWIST2Q8WVJ9 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TWIST2Q8WVJ9 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TWIST2Q8WVJ9 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TWIST2Q8WVJ9 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TWIST2Q8WVJ9 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TWIST2Q8WVJ9 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TWIST2Q8WVJ9 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TWIST2Q8WVJ9 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TWIST2Q8WVJ9 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TWIST2Q8WVJ9 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TWIST2Q8WVJ9 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TWIST2Q8WVJ9 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TWIST2Q8WVJ9 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TWIST2Q8WVJ9 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TWIST2Q8WVJ9 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TWIST2Q8WVJ9 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TWIST2Q8WVJ9 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TWIST2Q8WVJ9 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TWIST2Q8WVJ9 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TWIST2Q8WVJ9 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TWIST2Q8WVJ9 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TWIST2Q8WVJ9 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TWIST2Q8WVJ9 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TWIST2Q8WVJ9 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
TWIST2Q8WVJ9 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TWIST2Q8WVJ9 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TWIST2Q8WVJ9 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TWIST2Q8WVJ9 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TWIST2Q8WVJ9 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TWIST2Q8WVJ9 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TWIST2Q8WVJ9 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TWIST2Q8WVJ9 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TWIST2Q8WVJ9 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TWIST2Q8WVJ9 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TWIST2Q8WVJ9 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TWIST2Q8WVJ9 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TWIST2Q8WVJ9 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
TWIST2Q8WVJ9 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TWIST2Q8WVJ9 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TWIST2Q8WVJ9 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
TWIST2Q8WVJ9 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
TWIST2Q8WVJ9 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TWIST2Q8WVJ9 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TWIST2Q8WVJ9 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TWIST2Q8WVJ9 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TWIST2Q8WVJ9 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TWIST2Q8WVJ9 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TWIST2Q8WVJ9 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms