Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVF5

KCTD4, BTB/POZ domain-containing protein KCTD4, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCTD4Q8WVF5 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KCTD4Q8WVF5 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KCTD4Q8WVF5 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KCTD4Q8WVF5 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KCTD4Q8WVF5 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KCTD4Q8WVF5 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KCTD4Q8WVF5 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KCTD4Q8WVF5 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KCTD4Q8WVF5 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KCTD4Q8WVF5 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KCTD4Q8WVF5 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KCTD4Q8WVF5 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KCTD4Q8WVF5 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KCTD4Q8WVF5 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KCTD4Q8WVF5 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KCTD4Q8WVF5 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KCTD4Q8WVF5 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KCTD4Q8WVF5 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KCTD4Q8WVF5 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KCTD4Q8WVF5 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KCTD4Q8WVF5 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KCTD4Q8WVF5 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KCTD4Q8WVF5 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KCTD4Q8WVF5 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
KCTD4Q8WVF5 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KCTD4Q8WVF5 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
KCTD4Q8WVF5 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KCTD4Q8WVF5 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
KCTD4Q8WVF5 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
KCTD4Q8WVF5 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
KCTD4Q8WVF5 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
KCTD4Q8WVF5 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
KCTD4Q8WVF5 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
KCTD4Q8WVF5 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
KCTD4Q8WVF5 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
KCTD4Q8WVF5 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
KCTD4Q8WVF5 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
KCTD4Q8WVF5 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
KCTD4Q8WVF5 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
KCTD4Q8WVF5 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KCTD4Q8WVF5 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KCTD4Q8WVF5 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KCTD4Q8WVF5 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KCTD4Q8WVF5 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KCTD4Q8WVF5 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KCTD4Q8WVF5 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KCTD4Q8WVF5 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KCTD4Q8WVF5 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KCTD4Q8WVF5 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KCTD4Q8WVF5 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KCTD4Q8WVF5 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KCTD4Q8WVF5 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KCTD4Q8WVF5 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KCTD4Q8WVF5 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KCTD4Q8WVF5 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KCTD4Q8WVF5 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KCTD4Q8WVF5 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KCTD4Q8WVF5 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KCTD4Q8WVF5 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KCTD4Q8WVF5 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KCTD4Q8WVF5 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KCTD4Q8WVF5 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KCTD4Q8WVF5 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KCTD4Q8WVF5 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KCTD4Q8WVF5 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KCTD4Q8WVF5 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KCTD4Q8WVF5 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KCTD4Q8WVF5 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KCTD4Q8WVF5 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KCTD4Q8WVF5 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KCTD4Q8WVF5 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KCTD4Q8WVF5 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KCTD4Q8WVF5 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KCTD4Q8WVF5 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KCTD4Q8WVF5 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KCTD4Q8WVF5 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KCTD4Q8WVF5 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KCTD4Q8WVF5 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KCTD4Q8WVF5 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
KCTD4Q8WVF5 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KCTD4Q8WVF5 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KCTD4Q8WVF5 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KCTD4Q8WVF5 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
KCTD4Q8WVF5 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
KCTD4Q8WVF5 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
KCTD4Q8WVF5 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KCTD4Q8WVF5 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KCTD4Q8WVF5 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
KCTD4Q8WVF5 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KCTD4Q8WVF5 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KCTD4Q8WVF5 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
KCTD4Q8WVF5 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KCTD4Q8WVF5 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KCTD4Q8WVF5 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KCTD4Q8WVF5 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
KCTD4Q8WVF5 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KCTD4Q8WVF5 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KCTD4Q8WVF5 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
KCTD4Q8WVF5 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KCTD4Q8WVF5 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms