Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV16

DCAF4, DDB1- and CUL4-associated factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF4Q8WV16 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC25.33■■□□□ 1.64
DCAF4Q8WV16 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
DCAF4Q8WV16 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
DCAF4Q8WV16 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
DCAF4Q8WV16 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
DCAF4Q8WV16 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
DCAF4Q8WV16 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
DCAF4Q8WV16 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
DCAF4Q8WV16 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
DCAF4Q8WV16 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
DCAF4Q8WV16 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
DCAF4Q8WV16 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
DCAF4Q8WV16 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
DCAF4Q8WV16 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
DCAF4Q8WV16 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
DCAF4Q8WV16 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
DCAF4Q8WV16 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
DCAF4Q8WV16 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
DCAF4Q8WV16 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
DCAF4Q8WV16 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
DCAF4Q8WV16 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
DCAF4Q8WV16 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
DCAF4Q8WV16 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
DCAF4Q8WV16 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
DCAF4Q8WV16 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
DCAF4Q8WV16 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
DCAF4Q8WV16 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
DCAF4Q8WV16 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
DCAF4Q8WV16 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
DCAF4Q8WV16 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
DCAF4Q8WV16 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
DCAF4Q8WV16 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
DCAF4Q8WV16 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
DCAF4Q8WV16 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
DCAF4Q8WV16 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
DCAF4Q8WV16 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
DCAF4Q8WV16 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
DCAF4Q8WV16 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
DCAF4Q8WV16 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
DCAF4Q8WV16 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
DCAF4Q8WV16 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
DCAF4Q8WV16 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
DCAF4Q8WV16 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
DCAF4Q8WV16 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
DCAF4Q8WV16 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
DCAF4Q8WV16 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
DCAF4Q8WV16 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
DCAF4Q8WV16 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
DCAF4Q8WV16 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
DCAF4Q8WV16 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
DCAF4Q8WV16 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
DCAF4Q8WV16 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
DCAF4Q8WV16 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
DCAF4Q8WV16 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
DCAF4Q8WV16 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
DCAF4Q8WV16 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
DCAF4Q8WV16 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
DCAF4Q8WV16 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DCAF4Q8WV16 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DCAF4Q8WV16 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
DCAF4Q8WV16 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DCAF4Q8WV16 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DCAF4Q8WV16 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DCAF4Q8WV16 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
DCAF4Q8WV16 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
DCAF4Q8WV16 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
DCAF4Q8WV16 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
DCAF4Q8WV16 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DCAF4Q8WV16 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
DCAF4Q8WV16 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
DCAF4Q8WV16 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
DCAF4Q8WV16 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
DCAF4Q8WV16 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
DCAF4Q8WV16 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
DCAF4Q8WV16 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
DCAF4Q8WV16 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
DCAF4Q8WV16 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
DCAF4Q8WV16 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
DCAF4Q8WV16 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
DCAF4Q8WV16 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
DCAF4Q8WV16 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
DCAF4Q8WV16 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
DCAF4Q8WV16 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
DCAF4Q8WV16 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
DCAF4Q8WV16 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
DCAF4Q8WV16 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
DCAF4Q8WV16 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
DCAF4Q8WV16 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
DCAF4Q8WV16 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
DCAF4Q8WV16 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
DCAF4Q8WV16 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
DCAF4Q8WV16 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
DCAF4Q8WV16 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
DCAF4Q8WV16 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
DCAF4Q8WV16 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
DCAF4Q8WV16 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
DCAF4Q8WV16 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
DCAF4Q8WV16 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
DCAF4Q8WV16 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
DCAF4Q8WV16 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms